More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2906 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  100 
 
 
298 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  95.3 
 
 
298 aa  597  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  85.52 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  85.52 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  85.52 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  85.52 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  85.52 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  85.52 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  85.52 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  85.86 
 
 
298 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  84.83 
 
 
298 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  85.17 
 
 
298 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  84.14 
 
 
298 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  79.6 
 
 
304 aa  504  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  79.93 
 
 
305 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  79.93 
 
 
305 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  67.63 
 
 
308 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  59.79 
 
 
321 aa  344  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  59.65 
 
 
328 aa  341  8e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  53.15 
 
 
304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  54.84 
 
 
292 aa  332  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  57.45 
 
 
303 aa  332  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  57.45 
 
 
303 aa  332  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  55.76 
 
 
299 aa  324  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  54.51 
 
 
321 aa  322  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  56.23 
 
 
298 aa  322  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  54.68 
 
 
290 aa  322  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  54.32 
 
 
288 aa  318  5e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  54.48 
 
 
298 aa  318  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  56.94 
 
 
328 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  53.05 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  52.98 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50.34 
 
 
291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  54.77 
 
 
329 aa  312  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  53.57 
 
 
302 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  54.42 
 
 
329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  53.82 
 
 
351 aa  311  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  51.38 
 
 
321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  55 
 
 
304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  54.61 
 
 
312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  52.05 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  50 
 
 
322 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  55.97 
 
 
276 aa  306  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  50 
 
 
322 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  53.66 
 
 
321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  53.66 
 
 
321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  53.66 
 
 
321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  54.68 
 
 
334 aa  305  5.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  52.94 
 
 
339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  52.94 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  50.17 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  53.29 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  50.87 
 
 
317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  49.49 
 
 
357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  53.31 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  53.31 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  53.31 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  52.6 
 
 
334 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  52.28 
 
 
287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  50.87 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  52.4 
 
 
320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  54.48 
 
 
331 aa  302  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  52.8 
 
 
325 aa  302  6.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  52.96 
 
 
321 aa  301  7.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  53.82 
 
 
321 aa  301  7.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  52.07 
 
 
320 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  52.07 
 
 
320 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  50.34 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  51.8 
 
 
319 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  51.56 
 
 
327 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  51.23 
 
 
319 aa  300  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  51.06 
 
 
282 aa  300  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  52.78 
 
 
321 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  52.54 
 
 
297 aa  300  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  51.38 
 
 
330 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  51.39 
 
 
330 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  50.52 
 
 
317 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  52.61 
 
 
321 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  50.51 
 
 
325 aa  299  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  50.86 
 
 
314 aa  299  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1042  lipoyl synthase  54.09 
 
 
301 aa  299  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984199  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  50.35 
 
 
330 aa  298  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  50.69 
 
 
330 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  52.3 
 
 
320 aa  298  6e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  50.35 
 
 
330 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  50.69 
 
 
330 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  50.35 
 
 
330 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  50.69 
 
 
329 aa  298  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  50.69 
 
 
330 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  52.45 
 
 
328 aa  298  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  49.66 
 
 
311 aa  298  8e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  50.69 
 
 
329 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  53.82 
 
 
283 aa  298  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  50.69 
 
 
329 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  50.69 
 
 
329 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  50.69 
 
 
329 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  53.31 
 
 
321 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  53.31 
 
 
321 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  52.35 
 
 
329 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  52.52 
 
 
316 aa  297  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>