More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1042 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1042  lipoyl synthase  100 
 
 		 301 aa  623  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  85.29 
 
 		 306 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  74.82 
 
 		 298 aa  441  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  58.64 
 
 		 304 aa  361  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  59.57 
 
 		 308 aa  358  5e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  55.21 
 
 		 321 aa  335  7.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  53.29 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  53.29 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  52.05 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  52.11 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  51.76 
 
 		 298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  54.09 
 
 		 298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 298 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 298 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 298 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  54.18 
 
 		 297 aa  312  4.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 298 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 298 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 298 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 298 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 298 aa  309  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  53.55 
 
 		 294 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  53.45 
 
 		 289 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  53.43 
 
 		 289 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  50 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  50.92 
 
 		 299 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 355 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  52.38 
 
 		 297 aa  305  6e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  52.73 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  52.36 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  52.5 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  51.46 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  48.29 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  50.91 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.46 
 
 		 283 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 316 aa  300  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  52.54 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  48.79 
 
 		 302 aa  299  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  46.69 
 
 		 321 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  51.27 
 
 		 282 aa  299  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  48.1 
 
 		 340 aa  298  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  53.28 
 
 		 320 aa  298  6e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 330 aa  298  9e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 321 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  53.45 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  52.11 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  48.28 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  47.68 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  51.61 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  47.1 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  47.04 
 
 		 321 aa  295  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  47.57 
 
 		 329 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  47.57 
 
 		 330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  47.57 
 
 		 330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  47.57 
 
 		 330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  46.05 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  53.09 
 
 		 294 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 320 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 320 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  47.4 
 
 		 338 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  46.76 
 
 		 330 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  46.76 
 
 		 330 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  51.82 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  49.14 
 
 		 321 aa  295  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  47.04 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  47.04 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  47.4 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  47.04 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  47.04 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  46.36 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2014  lipoyl synthase  51.96 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.812557  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  47.04 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  46.38 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  48.23 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  47.04 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  47.4 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  47.04 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  47.04 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  47.87 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  46.88 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  47.22 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  47.04 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  47.22 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  48.66 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  47.04 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  47.04 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  47.04 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  47.22 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  47.06 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  50.73 
 
 		 319 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  46.13 
 
 		 323 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  46.76 
 
 		 334 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50.73 
 
 		 351 aa  292  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>