More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2572 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  100 
 
 		 319 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  85.89 
 
 		 319 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  85.27 
 
 		 319 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  85.89 
 
 		 319 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  87.14 
 
 		 319 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  87.95 
 
 		 319 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  87.46 
 
 		 319 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  77.53 
 
 		 322 aa  517  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  77.07 
 
 		 323 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  76.75 
 
 		 323 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  75.63 
 
 		 317 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  74.29 
 
 		 327 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  75 
 
 		 321 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  76.43 
 
 		 323 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  75.48 
 
 		 320 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  73.5 
 
 		 322 aa  504  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  71.83 
 
 		 334 aa  501  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  73.19 
 
 		 322 aa  501  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  75.8 
 
 		 328 aa  501  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  74.84 
 
 		 320 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  73.57 
 
 		 323 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  71.52 
 
 		 339 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  71.52 
 
 		 339 aa  500  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  73.44 
 
 		 321 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  76.25 
 
 		 325 aa  491  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  73.48 
 
 		 325 aa  490  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  73.18 
 
 		 315 aa  471  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  70.16 
 
 		 317 aa  471  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  72 
 
 		 320 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  72 
 
 		 320 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  68.21 
 
 		 351 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  72.52 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  70.86 
 
 		 316 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  70.96 
 
 		 315 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  69.44 
 
 		 325 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  70 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  69.18 
 
 		 329 aa  434  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  67.1 
 
 		 320 aa  428  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  67.87 
 
 		 314 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  64.55 
 
 		 310 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  64.85 
 
 		 312 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  66.32 
 
 		 311 aa  408  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  63.03 
 
 		 287 aa  392  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  61.32 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  60.98 
 
 		 297 aa  382  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  59.93 
 
 		 296 aa  355  3.9999999999999996e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  55.2 
 
 		 296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  56.23 
 
 		 324 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  57.61 
 
 		 329 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  57.61 
 
 		 330 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  51.59 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  56.88 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  56.88 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  56.88 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  57.04 
 
 		 339 aa  308  9e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  54.64 
 
 		 357 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.88 
 
 		 321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  57.04 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  52.67 
 
 		 337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  53.62 
 
 		 308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  51.46 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  56.52 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  55.96 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  53.79 
 
 		 327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  52.46 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  53.28 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  53.28 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  52.23 
 
 		 327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  50.49 
 
 		 340 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  51.21 
 
 		 355 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  55.8 
 
 		 335 aa  301  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  51.5 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  52.51 
 
 		 311 aa  300  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  50.68 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  55.43 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  53.65 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  52.63 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  52.55 
 
 		 292 aa  300  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  49.04 
 
 		 373 aa  299  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 298 aa  299  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  52.51 
 
 		 326 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  53.99 
 
 		 333 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  53.62 
 
 		 331 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  53.62 
 
 		 333 aa  298  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  49.04 
 
 		 373 aa  298  6e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  53.99 
 
 		 333 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 298 aa  297  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  50 
 
 		 298 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  53.43 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>