More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1124 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  100 
 
 
322 aa  668    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  99.69 
 
 
322 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  91.59 
 
 
321 aa  621  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  83.17 
 
 
322 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  80.63 
 
 
323 aa  547  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  81.9 
 
 
323 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  81.27 
 
 
323 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  80 
 
 
323 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  77.67 
 
 
317 aa  522  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  77.96 
 
 
325 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  75.55 
 
 
327 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  74.76 
 
 
319 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  76.36 
 
 
328 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  75.71 
 
 
319 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  75.4 
 
 
320 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  76.19 
 
 
317 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  73.07 
 
 
339 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  73.37 
 
 
334 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  73.07 
 
 
339 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  73.98 
 
 
320 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  74.13 
 
 
319 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  77.48 
 
 
325 aa  508  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  75.56 
 
 
319 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  75.57 
 
 
319 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  73.5 
 
 
319 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  74.05 
 
 
321 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  75.24 
 
 
319 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  70.25 
 
 
351 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  70.96 
 
 
325 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  71.95 
 
 
315 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  70.76 
 
 
320 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  70.76 
 
 
320 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  70.16 
 
 
316 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  70.86 
 
 
330 aa  457  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  70 
 
 
320 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  68.95 
 
 
315 aa  447  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  69.59 
 
 
320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  70.31 
 
 
329 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  65.91 
 
 
314 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  64.57 
 
 
310 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  65.98 
 
 
311 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  62.71 
 
 
312 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  64.44 
 
 
287 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  61.81 
 
 
297 aa  392  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  62.02 
 
 
299 aa  390  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  58.08 
 
 
296 aa  358  6e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  55.19 
 
 
357 aa  326  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  54.61 
 
 
373 aa  325  5e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  54.61 
 
 
373 aa  325  8.000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  56.03 
 
 
331 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  57.45 
 
 
326 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  57.45 
 
 
339 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  56.38 
 
 
333 aa  322  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  56.38 
 
 
333 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  52.81 
 
 
327 aa  322  6e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  57.45 
 
 
318 aa  322  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  56.03 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  54.61 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  57.35 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  50.33 
 
 
355 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  56.99 
 
 
329 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  51.77 
 
 
340 aa  319  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  56.99 
 
 
329 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  56.99 
 
 
329 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  55.67 
 
 
330 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  56.99 
 
 
329 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  55.43 
 
 
292 aa  318  7.999999999999999e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  56.99 
 
 
329 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  56.99 
 
 
329 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  56.63 
 
 
330 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  56.99 
 
 
329 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  53.09 
 
 
296 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  54.74 
 
 
291 aa  316  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  56.63 
 
 
330 aa  315  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  55.83 
 
 
332 aa  315  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  56.27 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.81 
 
 
283 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  55.12 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  56.27 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  56.03 
 
 
331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  53 
 
 
338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  55.68 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  53 
 
 
338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  51.31 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0287  lipoyl synthase  54.23 
 
 
314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0533885  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  52.65 
 
 
338 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  56.79 
 
 
334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  51.71 
 
 
318 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  56.43 
 
 
334 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  55.32 
 
 
327 aa  312  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  53.74 
 
 
324 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  55.12 
 
 
326 aa  310  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  55.12 
 
 
326 aa  310  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  53.09 
 
 
321 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  50.84 
 
 
327 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  52.3 
 
 
338 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  54.45 
 
 
289 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  54.06 
 
 
338 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  55.56 
 
 
330 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  55.56 
 
 
330 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>