More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1162 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  100 
 
 
291 aa  605  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  85.81 
 
 
289 aa  528  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  84.14 
 
 
294 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  84.08 
 
 
306 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  82.35 
 
 
289 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  82.01 
 
 
289 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  79.73 
 
 
297 aa  498  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  78.69 
 
 
292 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  68.64 
 
 
297 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  70.14 
 
 
294 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  68.75 
 
 
289 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19551  lipoyl synthase  68.75 
 
 
289 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2014  lipoyl synthase  67.71 
 
 
296 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.812557  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  68.06 
 
 
294 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17181  lipoyl synthase  65.52 
 
 
297 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.49341  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1606  lipoyl synthase  65.52 
 
 
297 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217435  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17061  lipoyl synthase  65.17 
 
 
297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0328  lipoyl synthase  67.01 
 
 
289 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0868642 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  54.23 
 
 
309 aa  322  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  55.76 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  55.76 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  55.12 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  53.05 
 
 
287 aa  318  1e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  54.87 
 
 
338 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  54.87 
 
 
338 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  54.87 
 
 
338 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  54.74 
 
 
322 aa  316  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  52.67 
 
 
283 aa  315  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  54.51 
 
 
327 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  54.51 
 
 
323 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  54.51 
 
 
338 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  51.07 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  52.84 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  54.38 
 
 
322 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  54.15 
 
 
318 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  52.31 
 
 
306 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  54.15 
 
 
335 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  52.9 
 
 
329 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  54.74 
 
 
322 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  54.38 
 
 
323 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  54.87 
 
 
324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  52.14 
 
 
325 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  54.38 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  53.05 
 
 
337 aa  309  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  52.92 
 
 
321 aa  308  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  50.35 
 
 
299 aa  308  5e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  52.65 
 
 
340 aa  308  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  53.43 
 
 
330 aa  309  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  52.9 
 
 
351 aa  308  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  54.18 
 
 
315 aa  308  9e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  53.24 
 
 
332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  53.43 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  54.01 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  53.24 
 
 
331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  53.43 
 
 
330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  53.28 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  53.24 
 
 
357 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  53.07 
 
 
334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  54.38 
 
 
323 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  53.07 
 
 
330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  53.07 
 
 
330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  53.07 
 
 
330 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  53.24 
 
 
326 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  53.43 
 
 
329 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  51.43 
 
 
355 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  53.65 
 
 
323 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  55.04 
 
 
330 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  53.07 
 
 
330 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  53.93 
 
 
324 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  53.07 
 
 
330 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  53.43 
 
 
329 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  53.43 
 
 
329 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  53.43 
 
 
329 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  53.43 
 
 
329 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  53.43 
 
 
329 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  53.43 
 
 
329 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  52.88 
 
 
327 aa  305  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  53.43 
 
 
329 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50.71 
 
 
291 aa  305  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  54.29 
 
 
315 aa  305  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  52.35 
 
 
334 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  54.01 
 
 
325 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  53.26 
 
 
321 aa  305  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  54.68 
 
 
316 aa  304  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  50.35 
 
 
297 aa  304  9.000000000000001e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  52.71 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  53.82 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  52.55 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  53.57 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  54.15 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  53.99 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  53.09 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  52.55 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  52.86 
 
 
337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  53.24 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  52 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  51.8 
 
 
280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  53.96 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  53.28 
 
 
319 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  53.96 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>