More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1436 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  100 
 
 
325 aa  672    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  76.45 
 
 
351 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  74.77 
 
 
321 aa  511  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  72.76 
 
 
323 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  72.4 
 
 
323 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  71.16 
 
 
321 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  72.4 
 
 
323 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  71.3 
 
 
317 aa  484  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  71.05 
 
 
322 aa  482  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  71.52 
 
 
339 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  71.52 
 
 
339 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  70.89 
 
 
334 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  72.7 
 
 
322 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  69.54 
 
 
325 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  70.72 
 
 
322 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  72.67 
 
 
320 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  74.33 
 
 
327 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  68.63 
 
 
323 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  71.52 
 
 
325 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  72.35 
 
 
320 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  71.85 
 
 
319 aa  472  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  70.96 
 
 
319 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  71.19 
 
 
319 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  72.64 
 
 
319 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  73.24 
 
 
328 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  69.54 
 
 
319 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  72.6 
 
 
319 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  73.97 
 
 
320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  69.13 
 
 
319 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  68.95 
 
 
315 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  67.76 
 
 
317 aa  447  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  66.36 
 
 
330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  70.26 
 
 
316 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  68.3 
 
 
315 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  70.71 
 
 
312 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  67.54 
 
 
320 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  67.1 
 
 
314 aa  434  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  67.54 
 
 
320 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  67.21 
 
 
320 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  68.71 
 
 
329 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  70.21 
 
 
311 aa  428  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  68.56 
 
 
310 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  64.79 
 
 
287 aa  402  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  63.54 
 
 
297 aa  401  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  62.54 
 
 
299 aa  396  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  60.14 
 
 
296 aa  362  4e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  54.18 
 
 
296 aa  320  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  54.28 
 
 
333 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  52.05 
 
 
331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  56.93 
 
 
328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1961  lipoyl synthase  53.42 
 
 
336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  53.95 
 
 
333 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  53.67 
 
 
330 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  54.74 
 
 
297 aa  315  6e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  53.14 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  56.73 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  55.12 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  53.27 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  53.27 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  53.27 
 
 
330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  52.94 
 
 
330 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  54.93 
 
 
373 aa  312  4.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  52.94 
 
 
330 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  52.94 
 
 
329 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  52.94 
 
 
329 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  52.94 
 
 
329 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  54.93 
 
 
373 aa  311  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  51.74 
 
 
333 aa  311  7.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  52.13 
 
 
330 aa  311  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  54.71 
 
 
309 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  52.74 
 
 
318 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  54.15 
 
 
355 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  54.42 
 
 
357 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  54.09 
 
 
294 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  50.31 
 
 
330 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  53.27 
 
 
329 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  52.61 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  52.61 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  52.61 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  51.29 
 
 
334 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  52.61 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  52.94 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  50.46 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  53.65 
 
 
294 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0287  lipoyl synthase  53.02 
 
 
314 aa  309  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0533885  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  55.47 
 
 
311 aa  309  5e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1668  lipoyl synthase  52.12 
 
 
336 aa  308  6.999999999999999e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.826169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  51.2 
 
 
321 aa  308  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  53.62 
 
 
283 aa  308  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  53.28 
 
 
291 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  54.42 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  52.17 
 
 
324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  52.05 
 
 
298 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  56.12 
 
 
327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  52.12 
 
 
315 aa  306  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  53.4 
 
 
332 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  53.62 
 
 
306 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  51.82 
 
 
292 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  53.09 
 
 
347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  54.73 
 
 
339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>