More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3346 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  100 
 
 
294 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  84.14 
 
 
291 aa  522  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  83.74 
 
 
289 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  83.04 
 
 
289 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  82.7 
 
 
306 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  79.24 
 
 
289 aa  498  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  78.55 
 
 
297 aa  484  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  76.55 
 
 
292 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  70.83 
 
 
294 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  67.01 
 
 
297 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2014  lipoyl synthase  69.79 
 
 
296 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.812557  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  69.1 
 
 
294 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  67.36 
 
 
289 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19551  lipoyl synthase  67.36 
 
 
289 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0328  lipoyl synthase  68.4 
 
 
289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0868642 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1606  lipoyl synthase  66.55 
 
 
297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217435  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17181  lipoyl synthase  66.9 
 
 
297 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.49341  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17061  lipoyl synthase  65.51 
 
 
297 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  57.25 
 
 
309 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  53.68 
 
 
287 aa  320  1.9999999999999998e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  52.13 
 
 
291 aa  318  9e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  53.26 
 
 
282 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  55.43 
 
 
321 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  55.4 
 
 
332 aa  315  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  55.04 
 
 
327 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  55.96 
 
 
329 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  55.96 
 
 
329 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  55.96 
 
 
329 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  55.96 
 
 
329 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  55.96 
 
 
329 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  56.52 
 
 
318 aa  315  7e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  55.96 
 
 
329 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  55.6 
 
 
330 aa  315  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  55.96 
 
 
329 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  55.04 
 
 
323 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  54.68 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  55.04 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  54.51 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  55.04 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  55.23 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  54.68 
 
 
357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  54.51 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  54.51 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  55.23 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  54.32 
 
 
326 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  55.04 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  55.6 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  55.23 
 
 
330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  54.51 
 
 
334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  55.43 
 
 
328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  54.15 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  54.87 
 
 
330 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  54.87 
 
 
330 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  53 
 
 
340 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  54.87 
 
 
330 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  52.33 
 
 
299 aa  311  6.999999999999999e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  54.15 
 
 
335 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  53.45 
 
 
312 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  54.15 
 
 
334 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  54.51 
 
 
325 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  51.43 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  54.87 
 
 
324 aa  309  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  53.79 
 
 
335 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  54.55 
 
 
315 aa  308  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  51.97 
 
 
337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  55.04 
 
 
330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  55.04 
 
 
331 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  53.65 
 
 
325 aa  308  6.999999999999999e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  51.41 
 
 
310 aa  308  8e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  53.07 
 
 
297 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  53.6 
 
 
326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  53.43 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  54.77 
 
 
314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  51.6 
 
 
320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  53.62 
 
 
298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  54.15 
 
 
314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  53.6 
 
 
326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  54.32 
 
 
332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  54.51 
 
 
320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  53.65 
 
 
322 aa  306  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  51.96 
 
 
306 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  54.38 
 
 
317 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  51.99 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  52.17 
 
 
329 aa  305  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  53.79 
 
 
324 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  54.35 
 
 
325 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  51.07 
 
 
321 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  54.91 
 
 
311 aa  305  8.000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  53.6 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  52.92 
 
 
321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  51.39 
 
 
351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  54.71 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  53.96 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.25 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  52.73 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  51.43 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1961  lipoyl synthase  52.84 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  53.28 
 
 
322 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  54.01 
 
 
323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  52.55 
 
 
319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>