More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0183 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  100 
 
 
306 aa  635    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  56.23 
 
 
297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  53.85 
 
 
306 aa  315  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  54.29 
 
 
289 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  54.38 
 
 
280 aa  311  6.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  52.31 
 
 
291 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  54.29 
 
 
289 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  51.27 
 
 
282 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  52.67 
 
 
292 aa  308  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  51.96 
 
 
294 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  54.18 
 
 
308 aa  305  6e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  51.07 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  52.5 
 
 
283 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  52.14 
 
 
289 aa  302  6.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  51.02 
 
 
317 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  51.02 
 
 
317 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  51.06 
 
 
298 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  50.7 
 
 
329 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  50.7 
 
 
329 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  50.7 
 
 
329 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  50.7 
 
 
329 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  50.7 
 
 
329 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  51.07 
 
 
324 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  50.7 
 
 
329 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  51.06 
 
 
329 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  50.7 
 
 
329 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  49.47 
 
 
327 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  52.67 
 
 
294 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  50.54 
 
 
320 aa  299  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  51.81 
 
 
311 aa  298  6e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  48.66 
 
 
347 aa  297  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  50 
 
 
334 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  50.18 
 
 
339 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2014  lipoyl synthase  52.8 
 
 
296 aa  296  3e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.812557  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  50.89 
 
 
297 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  50.18 
 
 
318 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  48.78 
 
 
332 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  49.64 
 
 
318 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  48.57 
 
 
325 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  50 
 
 
335 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  52.31 
 
 
289 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  51.58 
 
 
296 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  48.1 
 
 
357 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19551  lipoyl synthase  52.31 
 
 
289 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  49.65 
 
 
330 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  49.65 
 
 
330 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  49.64 
 
 
314 aa  294  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  47.5 
 
 
327 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  49.65 
 
 
330 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  47.68 
 
 
347 aa  293  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  49.65 
 
 
334 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  47.68 
 
 
347 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  50.72 
 
 
321 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  48.42 
 
 
337 aa  292  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  48.94 
 
 
338 aa  292  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  50.18 
 
 
325 aa  292  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  49.48 
 
 
331 aa  292  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  47.86 
 
 
338 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  47.86 
 
 
338 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  47.86 
 
 
338 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  47.14 
 
 
323 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  48.75 
 
 
326 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  51.09 
 
 
309 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  48.75 
 
 
326 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  47.86 
 
 
338 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  49.64 
 
 
321 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  49.64 
 
 
321 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  49.64 
 
 
321 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  49.64 
 
 
321 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  51.96 
 
 
294 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  49.64 
 
 
321 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  48.38 
 
 
335 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  48.38 
 
 
340 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  48.75 
 
 
332 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  51.26 
 
 
336 aa  289  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  48.74 
 
 
337 aa  289  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  48.91 
 
 
321 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  48.91 
 
 
321 aa  289  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  49.64 
 
 
321 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  50.87 
 
 
306 aa  289  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  48.91 
 
 
321 aa  289  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  48.91 
 
 
321 aa  289  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  48.91 
 
 
321 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  48.91 
 
 
321 aa  289  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  48.91 
 
 
321 aa  289  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  48.91 
 
 
321 aa  289  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  49.64 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  48.91 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  50 
 
 
326 aa  288  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1709  lipoyl synthase  48.55 
 
 
328 aa  288  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  48.38 
 
 
318 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  50 
 
 
321 aa  288  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  50.18 
 
 
373 aa  287  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  48.91 
 
 
321 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  48.04 
 
 
326 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  49.46 
 
 
299 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>