More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2076 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  100 
 
 		 299 aa  621  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  63.93 
 
 		 300 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2079  lipoyl synthase  62.99 
 
 		 298 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  61.87 
 
 		 291 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  55.23 
 
 		 296 aa  298  9e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  55.02 
 
 		 291 aa  298  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 294 aa  296  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 300 aa  296  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.64 
 
 		 283 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  52.54 
 
 		 328 aa  289  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50.7 
 
 		 303 aa  288  8e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50.7 
 
 		 303 aa  288  8e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19551  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 291 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 306 aa  286  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 287 aa  285  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  48 
 
 		 291 aa  285  9e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  51.96 
 
 		 288 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  52.38 
 
 		 297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  52.13 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  52.75 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  52.38 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  50.55 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 292 aa  280  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2014  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.812557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  48 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 294 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  51.64 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  50 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  48.41 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 288 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 280 aa  275  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 298 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  48.01 
 
 		 305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  47.97 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  46.49 
 
 		 290 aa  273  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  49.45 
 
 		 289 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 373 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 373 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  48.06 
 
 		 322 aa  271  7e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  47.87 
 
 		 322 aa  271  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 292 aa  270  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  51.4 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  47.87 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  47.65 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 281 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 296 aa  268  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  48.72 
 
 		 289 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  47.16 
 
 		 317 aa  267  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  45.16 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  46.72 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  47.89 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  48.43 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  47.87 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  49.11 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1709  lipoyl synthase  46.21 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  47.7 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  47.7 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0328  lipoyl synthase  51.61 
 
 		 289 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0868642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  45.1 
 
 		 290 aa  266  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  48.35 
 
 		 289 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  44.68 
 
 		 292 aa  265  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  46.91 
 
 		 333 aa  265  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  47.48 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  46.21 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  50.37 
 
 		 535 aa  264  1e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  46.29 
 
 		 302 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 323 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  48.78 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  48.54 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  48 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  47.35 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  44.77 
 
 		 308 aa  262  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  47.39 
 
 		 319 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  45.88 
 
 		 318 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 320 aa  262  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  45.45 
 
 		 311 aa  261  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  48.23 
 
 		 325 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 319 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.53 
 
 		 321 aa  261  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  46.21 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17181  lipoyl synthase  48.54 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.49341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  46.43 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  50 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>