More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3378 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  100 
 
 
325 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  100 
 
 
325 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  100 
 
 
325 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  84.92 
 
 
332 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  85.76 
 
 
317 aa  555  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  88.04 
 
 
306 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  87.38 
 
 
311 aa  548  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  85.95 
 
 
342 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  86.1 
 
 
341 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  84.39 
 
 
334 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  79.74 
 
 
332 aa  520  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  79.73 
 
 
333 aa  512  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  79.22 
 
 
333 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  78.71 
 
 
337 aa  508  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  77.74 
 
 
311 aa  504  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  77.53 
 
 
329 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  80.87 
 
 
305 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  78.53 
 
 
324 aa  504  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  78.74 
 
 
317 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  78.32 
 
 
316 aa  504  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  76.77 
 
 
333 aa  504  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  77.85 
 
 
312 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  77.42 
 
 
333 aa  502  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  79.19 
 
 
331 aa  498  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  76.62 
 
 
309 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  78.07 
 
 
308 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  74.83 
 
 
339 aa  488  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  76.39 
 
 
328 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  75.08 
 
 
320 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  71.56 
 
 
347 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  77.67 
 
 
323 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  73.23 
 
 
339 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  73.23 
 
 
335 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  73.23 
 
 
335 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  73.42 
 
 
333 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  71.29 
 
 
335 aa  463  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  72.19 
 
 
308 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  68.32 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  74.42 
 
 
323 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  68.77 
 
 
340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50.36 
 
 
291 aa  298  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  54.21 
 
 
303 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  54.21 
 
 
303 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  50.73 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  49.45 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.82 
 
 
308 aa  282  7.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  51.31 
 
 
535 aa  281  1e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  46.53 
 
 
325 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  46.88 
 
 
351 aa  279  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  45.09 
 
 
304 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  51.3 
 
 
291 aa  277  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  46.6 
 
 
318 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  47.45 
 
 
299 aa  276  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  51.03 
 
 
296 aa  275  7e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  47.25 
 
 
298 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  49.31 
 
 
328 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  45.26 
 
 
288 aa  271  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  45.62 
 
 
290 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  45.68 
 
 
292 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  47.99 
 
 
304 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  45.58 
 
 
321 aa  269  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  47.14 
 
 
298 aa  269  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  47.14 
 
 
298 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  45.16 
 
 
347 aa  269  5e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  46.79 
 
 
298 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  46.79 
 
 
298 aa  268  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  46.79 
 
 
298 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  46.79 
 
 
298 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  45.7 
 
 
314 aa  268  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  46.79 
 
 
298 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  46.79 
 
 
298 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  46.79 
 
 
298 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  47.14 
 
 
298 aa  267  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  46.79 
 
 
298 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  45.52 
 
 
325 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  43.93 
 
 
347 aa  267  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  47.29 
 
 
294 aa  267  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  43.93 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  50.75 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  47.39 
 
 
331 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  46.21 
 
 
315 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  46.44 
 
 
325 aa  266  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  46.13 
 
 
323 aa  265  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  47.22 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  47.89 
 
 
298 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  46.93 
 
 
355 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  45.36 
 
 
323 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  46.95 
 
 
307 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  45.62 
 
 
282 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  44.3 
 
 
321 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  47.75 
 
 
324 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  45.05 
 
 
337 aa  263  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  45.55 
 
 
330 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  45.82 
 
 
302 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  47.08 
 
 
298 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  46.03 
 
 
326 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  49.32 
 
 
334 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  46.76 
 
 
329 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  48.73 
 
 
298 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  45 
 
 
322 aa  262  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>