More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16470 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  100 
 
 
340 aa  709    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  71.17 
 
 
335 aa  505  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  69.79 
 
 
340 aa  504  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  69.07 
 
 
333 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  70.57 
 
 
333 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  68.15 
 
 
339 aa  491  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  68.45 
 
 
347 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  69.18 
 
 
332 aa  492  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  69.94 
 
 
337 aa  491  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  67.77 
 
 
335 aa  488  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  67.77 
 
 
335 aa  488  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  68.47 
 
 
333 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  71.48 
 
 
317 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  65.96 
 
 
334 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  66.97 
 
 
341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  65.24 
 
 
339 aa  465  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  65.76 
 
 
342 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  66.16 
 
 
333 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  67.21 
 
 
312 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  67.87 
 
 
317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  68.77 
 
 
325 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  68.77 
 
 
325 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  68.77 
 
 
325 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  68.54 
 
 
306 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  67.33 
 
 
308 aa  441  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  68.87 
 
 
329 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  68.33 
 
 
332 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  68.79 
 
 
331 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  65.78 
 
 
328 aa  437  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  65.35 
 
 
309 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  67.22 
 
 
320 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  65.58 
 
 
316 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  66.23 
 
 
311 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  66.45 
 
 
305 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  66.89 
 
 
311 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  65.81 
 
 
324 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  66.89 
 
 
323 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  62.79 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  64.12 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  60.8 
 
 
308 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  46.64 
 
 
303 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  46.64 
 
 
303 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  46.81 
 
 
321 aa  278  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  45.92 
 
 
318 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  45.83 
 
 
325 aa  275  9e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  44.76 
 
 
321 aa  268  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  45.42 
 
 
304 aa  268  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  45.7 
 
 
351 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  45.17 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  45.51 
 
 
317 aa  265  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  45.86 
 
 
320 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  46.72 
 
 
291 aa  265  7e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  44.85 
 
 
328 aa  265  8e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  46.21 
 
 
320 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  47.81 
 
 
309 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  46.18 
 
 
299 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  46.88 
 
 
291 aa  263  3e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  46.85 
 
 
337 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  42.54 
 
 
325 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  44.83 
 
 
321 aa  261  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  45.95 
 
 
535 aa  261  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  46.39 
 
 
327 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  44.95 
 
 
314 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  42.24 
 
 
304 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  43.17 
 
 
306 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  45.05 
 
 
298 aa  259  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  42.86 
 
 
292 aa  258  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  44.84 
 
 
320 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  44.33 
 
 
339 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  44.22 
 
 
326 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  42.9 
 
 
323 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  43.71 
 
 
315 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  44.33 
 
 
339 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  41.88 
 
 
302 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  45.99 
 
 
331 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  42.9 
 
 
323 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  44.57 
 
 
298 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  44.29 
 
 
321 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  45.79 
 
 
308 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  43.8 
 
 
299 aa  256  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  44.57 
 
 
298 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  44.2 
 
 
298 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  44.33 
 
 
334 aa  256  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  43.93 
 
 
322 aa  255  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  44.2 
 
 
298 aa  255  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  44.2 
 
 
298 aa  255  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  43.77 
 
 
320 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  44.2 
 
 
298 aa  255  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  42.67 
 
 
323 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  43.77 
 
 
320 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  44.2 
 
 
298 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  43.93 
 
 
322 aa  255  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  43.1 
 
 
323 aa  255  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  44.2 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  44.2 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  44.2 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  44.57 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  44.93 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  43.66 
 
 
298 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  46.24 
 
 
334 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>