More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0926 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  100 
 
 
323 aa  658    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  75.32 
 
 
311 aa  498  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  77.56 
 
 
323 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  76.72 
 
 
308 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  75.99 
 
 
305 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  73.36 
 
 
333 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  73.31 
 
 
316 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  75 
 
 
342 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  73.38 
 
 
329 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  72.15 
 
 
320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  73.44 
 
 
312 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  73.05 
 
 
331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  72.84 
 
 
333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  73.08 
 
 
328 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  74.01 
 
 
332 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  74.42 
 
 
325 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  73.18 
 
 
341 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  74.42 
 
 
325 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  73.68 
 
 
337 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  73.05 
 
 
308 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  74.42 
 
 
325 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  70.72 
 
 
333 aa  461  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  71.57 
 
 
334 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  72.22 
 
 
317 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  73.51 
 
 
332 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  71.9 
 
 
324 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  73.77 
 
 
311 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  71.05 
 
 
309 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  71.72 
 
 
333 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  73 
 
 
306 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  71.05 
 
 
333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  69.08 
 
 
317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  70.47 
 
 
339 aa  448  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  68.09 
 
 
347 aa  447  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  68.09 
 
 
339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  67.43 
 
 
335 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  67.43 
 
 
335 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  65.56 
 
 
335 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  64.12 
 
 
340 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  65.32 
 
 
340 aa  418  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  54.95 
 
 
303 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  54.95 
 
 
303 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.01 
 
 
321 aa  295  7e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50 
 
 
291 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  50.92 
 
 
304 aa  292  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  48.46 
 
 
325 aa  291  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  51.99 
 
 
320 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.82 
 
 
308 aa  285  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  47.87 
 
 
351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  49.14 
 
 
320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  49.82 
 
 
355 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  48.45 
 
 
320 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.55 
 
 
318 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  53.16 
 
 
276 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  46.64 
 
 
317 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  45.54 
 
 
321 aa  279  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  47.89 
 
 
321 aa  278  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  52.16 
 
 
322 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  47.8 
 
 
339 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  47.92 
 
 
325 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  49.46 
 
 
329 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  47.8 
 
 
339 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  49.27 
 
 
328 aa  275  9e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  48.08 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  47.54 
 
 
315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  47.54 
 
 
315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  46.32 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  45.97 
 
 
314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  47.2 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  47.8 
 
 
326 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  44.27 
 
 
320 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  47.29 
 
 
296 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  46.32 
 
 
322 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  44 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  45.29 
 
 
283 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  44.48 
 
 
323 aa  272  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  47.06 
 
 
320 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  46.98 
 
 
324 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  45.61 
 
 
315 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  47.12 
 
 
300 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  46.67 
 
 
321 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  45.95 
 
 
328 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  47.99 
 
 
298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  45.82 
 
 
302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  47.72 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  50.35 
 
 
296 aa  269  4e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  43.33 
 
 
347 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  45.61 
 
 
319 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  43.33 
 
 
347 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  46.13 
 
 
319 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  43.71 
 
 
304 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  45.61 
 
 
327 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  45.7 
 
 
325 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  47.83 
 
 
320 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  48.03 
 
 
307 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  46.91 
 
 
319 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  47.83 
 
 
320 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  45.62 
 
 
282 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  44.91 
 
 
317 aa  267  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  49.01 
 
 
535 aa  267  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>