More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3099 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  100 
 
 
305 aa  624  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  84.21 
 
 
308 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  85.76 
 
 
329 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  83.55 
 
 
311 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  84.44 
 
 
331 aa  534  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  82.57 
 
 
334 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  82.72 
 
 
316 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  82.3 
 
 
312 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  79.34 
 
 
309 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  80.59 
 
 
324 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  79.93 
 
 
332 aa  511  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  80.87 
 
 
325 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  79.61 
 
 
337 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  80.87 
 
 
325 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  80.87 
 
 
325 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  79 
 
 
317 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  78.79 
 
 
341 aa  501  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  78.67 
 
 
342 aa  500  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  76.67 
 
 
320 aa  500  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  76.32 
 
 
333 aa  500  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  78.48 
 
 
332 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  75.33 
 
 
333 aa  494  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  77.96 
 
 
333 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  76.64 
 
 
328 aa  494  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  79.39 
 
 
323 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  77.63 
 
 
317 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  77.63 
 
 
333 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  78.33 
 
 
306 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  75.76 
 
 
339 aa  487  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  75.66 
 
 
333 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  78.07 
 
 
311 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  73.36 
 
 
308 aa  471  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  71.76 
 
 
335 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  71.76 
 
 
335 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  71.43 
 
 
339 aa  467  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  71.43 
 
 
347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  75.99 
 
 
323 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  68.11 
 
 
335 aa  447  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  68.44 
 
 
340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  66.45 
 
 
340 aa  438  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  55.09 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  55.09 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.45 
 
 
308 aa  290  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  49.64 
 
 
291 aa  288  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.77 
 
 
321 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  47.44 
 
 
325 aa  287  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  52.19 
 
 
328 aa  286  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  47.51 
 
 
326 aa  282  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  48.11 
 
 
351 aa  281  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  46.88 
 
 
321 aa  281  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  50.19 
 
 
291 aa  278  7e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  47.72 
 
 
304 aa  277  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  48.01 
 
 
299 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  44.76 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  47.86 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  47.86 
 
 
298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  46.91 
 
 
302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  45.45 
 
 
318 aa  272  6e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  51.09 
 
 
535 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  47.86 
 
 
298 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  46.4 
 
 
292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  46.37 
 
 
291 aa  269  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  45.26 
 
 
292 aa  269  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  47.06 
 
 
300 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  46.72 
 
 
309 aa  268  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  45.61 
 
 
320 aa  268  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  48.43 
 
 
298 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  50.38 
 
 
276 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  46.76 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  44.41 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  48.08 
 
 
298 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  46.85 
 
 
320 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  45.08 
 
 
320 aa  265  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  44.44 
 
 
314 aa  265  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  44.41 
 
 
321 aa  265  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  46.52 
 
 
298 aa  265  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  45.99 
 
 
288 aa  265  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  43.39 
 
 
322 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  46.18 
 
 
315 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  46.18 
 
 
315 aa  264  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  46.1 
 
 
339 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  44.93 
 
 
299 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  43.39 
 
 
322 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  46.83 
 
 
348 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  47.22 
 
 
328 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  44.26 
 
 
315 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  46.1 
 
 
339 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  44.07 
 
 
328 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  45.85 
 
 
300 aa  263  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  44.89 
 
 
290 aa  263  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  46.95 
 
 
320 aa  262  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  44.07 
 
 
325 aa  262  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>