More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2109 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  100 
 
 
337 aa  686    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  87.99 
 
 
333 aa  608  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  87.92 
 
 
332 aa  597  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  84.98 
 
 
333 aa  588  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  83.49 
 
 
339 aa  574  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  75.68 
 
 
333 aa  544  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  77.41 
 
 
334 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  77.27 
 
 
342 aa  534  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  75.99 
 
 
341 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  76.28 
 
 
333 aa  524  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  72.24 
 
 
335 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  72.59 
 
 
335 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  71.73 
 
 
347 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  79.74 
 
 
312 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  80.07 
 
 
317 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  71.09 
 
 
339 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  78.71 
 
 
325 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  78.71 
 
 
325 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  78.71 
 
 
325 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  78.69 
 
 
329 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  79.61 
 
 
305 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  78.03 
 
 
311 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  77.49 
 
 
331 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  80.46 
 
 
306 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  77.12 
 
 
317 aa  501  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  76.56 
 
 
332 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  77.45 
 
 
308 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  69.97 
 
 
340 aa  500  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  76.14 
 
 
309 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  76.21 
 
 
316 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  68.06 
 
 
335 aa  491  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  77.12 
 
 
324 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  77.27 
 
 
311 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  74.17 
 
 
320 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  78.26 
 
 
323 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  67.46 
 
 
340 aa  475  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  75.33 
 
 
328 aa  474  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  72.7 
 
 
333 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  71.8 
 
 
308 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  73.68 
 
 
323 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  52.38 
 
 
303 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  52.38 
 
 
303 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  49.47 
 
 
325 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.25 
 
 
318 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  51.09 
 
 
328 aa  288  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50.34 
 
 
351 aa  287  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  49.64 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  49.45 
 
 
304 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  47.65 
 
 
304 aa  282  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  48 
 
 
299 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  45.88 
 
 
347 aa  280  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.45 
 
 
308 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  44.64 
 
 
347 aa  277  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  44.64 
 
 
347 aa  277  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  50.19 
 
 
291 aa  275  7e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  47.56 
 
 
328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  49.28 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  52.55 
 
 
535 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  47.12 
 
 
323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  45.36 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  46.96 
 
 
320 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  45.62 
 
 
288 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  49.27 
 
 
309 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  47.39 
 
 
314 aa  272  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  47.54 
 
 
321 aa  272  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  47.99 
 
 
321 aa  271  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  46.13 
 
 
325 aa  271  9e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  49.28 
 
 
320 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  46.71 
 
 
321 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  47.31 
 
 
298 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  48.56 
 
 
324 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  46.21 
 
 
302 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  46.64 
 
 
328 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  48.07 
 
 
339 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  48.07 
 
 
339 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  47.22 
 
 
315 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  47.64 
 
 
319 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  45.3 
 
 
323 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  45.26 
 
 
290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  45.61 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  47.22 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  46.62 
 
 
320 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  46.95 
 
 
298 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  46.95 
 
 
298 aa  269  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  46.95 
 
 
298 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  46.95 
 
 
298 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  43.71 
 
 
322 aa  269  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  44.27 
 
 
323 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  48 
 
 
320 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  43.71 
 
 
322 aa  269  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  46.95 
 
 
298 aa  269  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  45.61 
 
 
355 aa  269  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  46.1 
 
 
330 aa  269  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  45.7 
 
 
315 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  48 
 
 
319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  45.52 
 
 
338 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  44.41 
 
 
329 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  45.52 
 
 
338 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  47.31 
 
 
298 aa  268  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  46.38 
 
 
292 aa  268  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>