More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2080 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  100 
 
 		 298 aa  620  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  61.37 
 
 		 321 aa  351  8e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  57.3 
 
 		 304 aa  345  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  59.78 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  54.26 
 
 		 292 aa  338  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  56.99 
 
 		 299 aa  337  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  55.23 
 
 		 321 aa  335  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  54.74 
 
 		 288 aa  332  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  54.8 
 
 		 298 aa  331  9e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  54.01 
 
 		 290 aa  329  4e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  55.16 
 
 		 298 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  54.91 
 
 		 290 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  55.47 
 
 		 302 aa  328  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  54.79 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  56.23 
 
 		 298 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  55.91 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  52.54 
 
 		 292 aa  319  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  54.35 
 
 		 303 aa  316  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  54.35 
 
 		 303 aa  316  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  51.27 
 
 		 300 aa  308  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  54.15 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  53.6 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  51.43 
 
 		 294 aa  298  9e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50.68 
 
 		 351 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 328 aa  296  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  51.29 
 
 		 291 aa  295  5e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 305 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 305 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  51.23 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  52.71 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  51.94 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  50.69 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  52.36 
 
 		 320 aa  285  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  51.23 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  50.55 
 
 		 287 aa  285  7e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 315 aa  285  8e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  49.27 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  50.54 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 350 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  48.75 
 
 		 326 aa  281  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  50 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  48.35 
 
 		 320 aa  281  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  49.83 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  51.81 
 
 		 535 aa  281  1e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  50 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  48.35 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 315 aa  279  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  51.23 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  48.78 
 
 		 317 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  46.91 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  49.08 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  49.3 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  49.08 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 315 aa  279  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 291 aa  279  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 329 aa  278  6e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 322 aa  277  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  48.4 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 327 aa  277  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  49.13 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  49.3 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  49.3 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.87 
 
 		 318 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  46.89 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  46.89 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  51.64 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  49.63 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  48.6 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  48.59 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  46.81 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  48.06 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  48.77 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>