More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16380 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  100 
 
 		 340 aa  705    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  73.27 
 
 		 335 aa  514  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  69.79 
 
 		 340 aa  504  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  69.55 
 
 		 333 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  69.25 
 
 		 333 aa  487  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  67.56 
 
 		 334 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  73.77 
 
 		 317 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  67.46 
 
 		 333 aa  471  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  68.29 
 
 		 337 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  67.57 
 
 		 342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  66.57 
 
 		 341 aa  465  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  71.48 
 
 		 312 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  66.07 
 
 		 332 aa  461  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  63.02 
 
 		 339 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  63.06 
 
 		 335 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  63.06 
 
 		 335 aa  454  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  63.28 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  68.85 
 
 		 317 aa  455  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  66.98 
 
 		 333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  68.32 
 
 		 325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  68.87 
 
 		 311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  68.32 
 
 		 325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  68.32 
 
 		 325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  69.44 
 
 		 306 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  69.67 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  63.33 
 
 		 339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  68.77 
 
 		 311 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  69.64 
 
 		 308 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  68.44 
 
 		 305 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  68.54 
 
 		 329 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  67.43 
 
 		 309 aa  437  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  67.66 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  66.45 
 
 		 320 aa  435  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  66.34 
 
 		 316 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  66.45 
 
 		 333 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  66.45 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  65.25 
 
 		 324 aa  428  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  66.78 
 
 		 323 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  65.32 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  61.97 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  48.76 
 
 		 303 aa  296  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  48.76 
 
 		 303 aa  296  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  49.31 
 
 		 325 aa  295  9e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  50.55 
 
 		 321 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  49.32 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  47.08 
 
 		 291 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  49.16 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  47.24 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  45.85 
 
 		 325 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  48.35 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  47.95 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  47.95 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  47.72 
 
 		 351 aa  279  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  46.84 
 
 		 317 aa  279  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  47.93 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  47.93 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  46.94 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  45.95 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  45.03 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  45.03 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  45.21 
 
 		 315 aa  275  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  46.9 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  45.48 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  47 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  46.21 
 
 		 321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  47.81 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  47 
 
 		 339 aa  272  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  45.76 
 
 		 318 aa  272  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  47 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  47.4 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  45.87 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  44.73 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  44.87 
 
 		 323 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  46.93 
 
 		 337 aa  270  4e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  45.83 
 
 		 321 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  48.54 
 
 		 309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  45.89 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  44.87 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  47.22 
 
 		 291 aa  268  7e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  47.23 
 
 		 328 aa  268  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  47.87 
 
 		 316 aa  268  8e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  46.84 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  44.91 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  46.4 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  44.37 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  45.68 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  44.69 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  44.77 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  44.69 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 331 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  46.07 
 
 		 319 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  44.01 
 
 		 288 aa  265  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  43.17 
 
 		 292 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  45.62 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  47.8 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  45.3 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  47.27 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  46.91 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>