More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1742 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  100 
 
 
328 aa  678    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  65 
 
 
331 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  62.79 
 
 
324 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  62.24 
 
 
329 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  62.24 
 
 
329 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  61.79 
 
 
348 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  61.49 
 
 
350 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  60.26 
 
 
334 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  61.15 
 
 
368 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  59.8 
 
 
335 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  55.86 
 
 
326 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  55.52 
 
 
326 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  55.17 
 
 
326 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  56.23 
 
 
298 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  55.17 
 
 
298 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  55.52 
 
 
298 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  55.52 
 
 
298 aa  317  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  55.52 
 
 
298 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  55.87 
 
 
298 aa  317  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  55.52 
 
 
298 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  54.48 
 
 
298 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  54.48 
 
 
298 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  54.48 
 
 
298 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  56.94 
 
 
298 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  55.16 
 
 
298 aa  315  7e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  55.83 
 
 
298 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  55.87 
 
 
294 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  55.56 
 
 
308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  52.8 
 
 
413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.82 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  54.61 
 
 
291 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  54.12 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  53.17 
 
 
398 aa  301  8.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  50.53 
 
 
299 aa  301  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  51.71 
 
 
314 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  53.41 
 
 
303 aa  299  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  53.41 
 
 
303 aa  299  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  50.33 
 
 
304 aa  299  5e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  50.78 
 
 
401 aa  298  7e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  51.8 
 
 
298 aa  296  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  51.96 
 
 
305 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  51.96 
 
 
305 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  52.16 
 
 
307 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  53.24 
 
 
282 aa  294  1e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  50.36 
 
 
288 aa  294  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  51.93 
 
 
285 aa  294  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3599  lipoic acid synthetase  52.04 
 
 
320 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  51.89 
 
 
311 aa  293  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  51.76 
 
 
321 aa  292  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  50.18 
 
 
290 aa  291  9e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  51.51 
 
 
308 aa  290  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1669  lipoic acid synthetase  51.37 
 
 
321 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  51.05 
 
 
324 aa  290  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  51.43 
 
 
304 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  52.52 
 
 
292 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  52.45 
 
 
399 aa  289  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  51.21 
 
 
395 aa  287  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  46.33 
 
 
321 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  46.01 
 
 
321 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  46.01 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  46.01 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  46.01 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50.72 
 
 
291 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  50.17 
 
 
312 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  52.48 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  48.93 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  52.9 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  51.07 
 
 
309 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  52.48 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  46.47 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.56 
 
 
318 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  44.87 
 
 
321 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  44.87 
 
 
321 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  50.18 
 
 
287 aa  281  1e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  44.87 
 
 
321 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  49.46 
 
 
299 aa  281  1e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  44.87 
 
 
321 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  47.12 
 
 
297 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  44.87 
 
 
321 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  44.87 
 
 
321 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  44.87 
 
 
321 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  46.01 
 
 
321 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  44.87 
 
 
321 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  46.79 
 
 
321 aa  281  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  44.87 
 
 
321 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  46.94 
 
 
321 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  46.94 
 
 
321 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  46.94 
 
 
321 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  49.31 
 
 
326 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  45.83 
 
 
321 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  45.69 
 
 
321 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  46.94 
 
 
321 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  48.42 
 
 
304 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  47.12 
 
 
292 aa  280  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  46.94 
 
 
321 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  50.18 
 
 
297 aa  280  3e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  50 
 
 
321 aa  279  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  48.94 
 
 
324 aa  278  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  49.29 
 
 
336 aa  278  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  47.6 
 
 
290 aa  278  8e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>