More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1092 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  100 
 
 
312 aa  648    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  55.79 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  55.23 
 
 
298 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  54.87 
 
 
298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  54.87 
 
 
298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  54.87 
 
 
298 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  54.87 
 
 
298 aa  309  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  54.87 
 
 
298 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  54.87 
 
 
298 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  54.87 
 
 
298 aa  308  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  54.87 
 
 
298 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  54.87 
 
 
298 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  54.61 
 
 
298 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  53.63 
 
 
298 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  54.15 
 
 
298 aa  306  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  50.36 
 
 
292 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  51.64 
 
 
304 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  51.94 
 
 
305 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  51.62 
 
 
325 aa  296  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  51.94 
 
 
305 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  52 
 
 
321 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  53.71 
 
 
294 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  50 
 
 
304 aa  295  6e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  50.97 
 
 
314 aa  295  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.82 
 
 
308 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  50.73 
 
 
299 aa  293  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  49.31 
 
 
291 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  51.05 
 
 
329 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  50.72 
 
 
322 aa  289  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  49.48 
 
 
322 aa  288  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  49.48 
 
 
322 aa  288  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  50.55 
 
 
282 aa  287  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  53.65 
 
 
303 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  52.67 
 
 
326 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  52.17 
 
 
325 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  49.27 
 
 
288 aa  287  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  53.65 
 
 
303 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  51.79 
 
 
319 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  52.5 
 
 
326 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  50.35 
 
 
326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  51.64 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  51.26 
 
 
323 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  50.68 
 
 
320 aa  285  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  51.26 
 
 
323 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  50.36 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  49.46 
 
 
312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  51.96 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  50.54 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  51.26 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  50.18 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  47.44 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  47.37 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  50.18 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  50.18 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  49.45 
 
 
319 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  51.26 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  51.08 
 
 
320 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  51.08 
 
 
320 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  48.45 
 
 
348 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  51.26 
 
 
323 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  48.4 
 
 
290 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  50.35 
 
 
320 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  49.82 
 
 
319 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  50.52 
 
 
368 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50.72 
 
 
351 aa  279  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  50.9 
 
 
335 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  49.82 
 
 
319 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  45.99 
 
 
290 aa  279  5e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  49.46 
 
 
339 aa  279  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  50.73 
 
 
304 aa  278  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  49.46 
 
 
339 aa  278  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  50.54 
 
 
334 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  50.54 
 
 
317 aa  278  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  49.46 
 
 
334 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.55 
 
 
282 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  44.86 
 
 
300 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  49.82 
 
 
297 aa  277  2e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  48 
 
 
302 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  48.56 
 
 
311 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  48.75 
 
 
283 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  50.36 
 
 
325 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  47.46 
 
 
290 aa  276  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  50.54 
 
 
330 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  47.48 
 
 
317 aa  276  4e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  50 
 
 
316 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  49.28 
 
 
355 aa  275  9e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  50.18 
 
 
330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  50.18 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  50.18 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  50.18 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  47.96 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  50.18 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  48.36 
 
 
298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  50.18 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  49.64 
 
 
315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  47.57 
 
 
308 aa  273  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  48.18 
 
 
287 aa  273  4.0000000000000004e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  48.74 
 
 
314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  47.47 
 
 
331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>