More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3328 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  100 
 
 		 331 aa  674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  94.56 
 
 		 329 aa  634    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  85.57 
 
 		 311 aa  541  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  84.44 
 
 		 305 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  80.84 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  81.7 
 
 		 332 aa  527  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  81.64 
 
 		 317 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  80.98 
 
 		 309 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  81.31 
 
 		 308 aa  524  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  82.27 
 
 		 312 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  82 
 
 		 323 aa  514  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  79.02 
 
 		 333 aa  514  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  76.78 
 
 		 324 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  78.64 
 
 		 316 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  77.99 
 
 		 341 aa  508  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  77.39 
 
 		 337 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  76.62 
 
 		 317 aa  501  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  77.17 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  77.78 
 
 		 333 aa  501  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  77.17 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  77.17 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  78.48 
 
 		 306 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  77.45 
 
 		 333 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  77.27 
 
 		 342 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  78.07 
 
 		 320 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  77.78 
 
 		 328 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  77.12 
 
 		 333 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  77.56 
 
 		 332 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  76.64 
 
 		 311 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  75.33 
 
 		 339 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  75.58 
 
 		 333 aa  481  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  72.52 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  73.53 
 
 		 335 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  73.86 
 
 		 339 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  73.53 
 
 		 335 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  69.87 
 
 		 335 aa  464  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  70.39 
 
 		 308 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  73.05 
 
 		 323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  68.77 
 
 		 340 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  67.65 
 
 		 340 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  53.11 
 
 		 303 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  53.11 
 
 		 303 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  47.08 
 
 		 291 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  45.8 
 
 		 304 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  46.83 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  46.08 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  47.62 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  50.36 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  45.6 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  45.02 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  49.44 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  44.9 
 
 		 298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  44.9 
 
 		 298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  45.24 
 
 		 298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  44.9 
 
 		 298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  45.24 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  44.9 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  44.9 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  44.9 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  44.9 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  44.9 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  45.24 
 
 		 298 aa  271  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  45.76 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  46.21 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  47.25 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  46.55 
 
 		 302 aa  268  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  44.72 
 
 		 288 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  46.1 
 
 		 535 aa  267  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  44.41 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  50 
 
 		 276 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  43.62 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  45.85 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  44.96 
 
 		 292 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  44.44 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  45.26 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  46.48 
 
 		 329 aa  263  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  46.5 
 
 		 298 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  45.45 
 
 		 320 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  43.27 
 
 		 324 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  44.59 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  42.86 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  44.64 
 
 		 291 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  42.91 
 
 		 321 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  43.43 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  43.05 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  44.89 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  45.49 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  43.05 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  43.05 
 
 		 322 aa  259  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  47.48 
 
 		 281 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  43.62 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  43.43 
 
 		 320 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  40.8 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  42.86 
 
 		 323 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  43.73 
 
 		 339 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  43.73 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  45.13 
 
 		 296 aa  258  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  43.73 
 
 		 339 aa  258  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>