More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3202 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  100 
 
 		 292 aa  610  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  83.77 
 
 		 302 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  77.93 
 
 		 290 aa  484  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  66.78 
 
 		 292 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  66.32 
 
 		 304 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  59.03 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  60.87 
 
 		 288 aa  354  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  59.14 
 
 		 290 aa  345  8e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  57.71 
 
 		 299 aa  343  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  52.54 
 
 		 298 aa  319  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  53.62 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 308 aa  311  7.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  49.3 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  49.3 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  48.45 
 
 		 304 aa  299  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 304 aa  297  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  48.07 
 
 		 311 aa  295  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  48 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  49.3 
 
 		 298 aa  292  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  46.98 
 
 		 282 aa  291  8e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 298 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 294 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 287 aa  288  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  48.25 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.92 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  45.55 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  45.55 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  46.58 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  45.55 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 350 aa  285  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  45.55 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  45.1 
 
 		 298 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  45.39 
 
 		 318 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  45.39 
 
 		 340 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  48.41 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  48.41 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  45.05 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  45.55 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  48.06 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  48.06 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  48.06 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  48.06 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  48.06 
 
 		 298 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  48.06 
 
 		 298 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  48.06 
 
 		 298 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  48.06 
 
 		 298 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  46.91 
 
 		 297 aa  281  8.000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 283 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  47.48 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 292 aa  280  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  43.84 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  45.49 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  51.11 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  47.83 
 
 		 299 aa  280  3e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  44.86 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 294 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  48.18 
 
 		 325 aa  278  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  45.49 
 
 		 334 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 351 aa  278  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  45.14 
 
 		 330 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 297 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  47.84 
 
 		 323 aa  277  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  45.14 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  45.14 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  45.21 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  44.44 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  44.44 
 
 		 329 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  44.44 
 
 		 329 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  45.94 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  44.44 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  44.44 
 
 		 329 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  47.48 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  46.95 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  43.54 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  46.21 
 
 		 347 aa  276  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  46.91 
 
 		 282 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  47.64 
 
 		 316 aa  275  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 292 aa  275  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  47.08 
 
 		 325 aa  275  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  44.1 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  44.1 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  44.1 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  44.1 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  48 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  47.84 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>