More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1084 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  100 
 
 
291 aa  600  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  64.85 
 
 
294 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  61.27 
 
 
287 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  60.58 
 
 
300 aa  364  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  61.19 
 
 
292 aa  358  5e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  62.55 
 
 
292 aa  348  6e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  59.57 
 
 
288 aa  342  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  54.74 
 
 
328 aa  308  8e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  51.41 
 
 
298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  55.07 
 
 
299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.55 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  53.65 
 
 
308 aa  302  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  53.09 
 
 
316 aa  299  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  51.09 
 
 
298 aa  298  8e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  48.39 
 
 
292 aa  297  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  51.09 
 
 
298 aa  297  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  53.45 
 
 
309 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  50.72 
 
 
298 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  50.72 
 
 
298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  50.72 
 
 
298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  50.72 
 
 
298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  50.72 
 
 
298 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  50.72 
 
 
298 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  50.72 
 
 
298 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  50.72 
 
 
298 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  53.26 
 
 
281 aa  295  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  50.36 
 
 
298 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  51.45 
 
 
303 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  51.45 
 
 
303 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.55 
 
 
282 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  51.26 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  51.26 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  50.9 
 
 
321 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  49.09 
 
 
320 aa  292  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  54.48 
 
 
296 aa  292  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  49.12 
 
 
314 aa  291  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  51.62 
 
 
321 aa  291  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  47.81 
 
 
304 aa  291  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  50.89 
 
 
283 aa  291  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  52.67 
 
 
322 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  49.28 
 
 
294 aa  289  3e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  50.7 
 
 
298 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  51.26 
 
 
321 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  48.35 
 
 
299 aa  289  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  48 
 
 
288 aa  288  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  50.18 
 
 
298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  50.71 
 
 
321 aa  288  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  51.64 
 
 
332 aa  288  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  49.82 
 
 
321 aa  288  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  49.82 
 
 
321 aa  287  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  49.82 
 
 
321 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  51.26 
 
 
319 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  49.82 
 
 
321 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  48.97 
 
 
333 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  50.54 
 
 
321 aa  287  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  48.94 
 
 
321 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  49.46 
 
 
321 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  50.54 
 
 
321 aa  286  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  50.35 
 
 
321 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  50.54 
 
 
321 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  50.35 
 
 
321 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  51.59 
 
 
298 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  49.82 
 
 
304 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  50.35 
 
 
321 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  50.36 
 
 
294 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  50.55 
 
 
305 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  48.97 
 
 
341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  51.64 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  51.64 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  49.09 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  51.64 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  47.62 
 
 
290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  49.12 
 
 
320 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  49.1 
 
 
337 aa  285  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  50 
 
 
321 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  50.54 
 
 
321 aa  285  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  49.09 
 
 
291 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  49.13 
 
 
308 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  50.71 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  50.91 
 
 
314 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  50.71 
 
 
315 aa  285  7e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  51.27 
 
 
306 aa  285  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  51.64 
 
 
311 aa  285  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  48 
 
 
347 aa  285  8e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>