More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1370 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  100 
 
 		 288 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  69.47 
 
 		 292 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  61.92 
 
 		 294 aa  364  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  61.59 
 
 		 287 aa  358  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  59.42 
 
 		 300 aa  355  5e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  62.09 
 
 		 292 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  58.74 
 
 		 291 aa  329  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  51.96 
 
 		 281 aa  298  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  51.46 
 
 		 321 aa  288  7e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 288 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  47 
 
 		 292 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  49.65 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  52.36 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  49.65 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  51.96 
 
 		 299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3150  lipoyl synthase  50 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  50.73 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  51.09 
 
 		 328 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 297 aa  278  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 308 aa  278  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  47.84 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  47.16 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  49.3 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  45.99 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2079  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  48.18 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  46.69 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  47.48 
 
 		 282 aa  272  6e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 282 aa  271  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  45.04 
 
 		 291 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 291 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 289 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2239  lipoyl synthase  50 
 
 		 280 aa  270  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 292 aa  268  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 312 aa  267  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  47.87 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  45.99 
 
 		 302 aa  266  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  47.16 
 
 		 291 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  47.39 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  46.64 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  47.39 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  47.39 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  46.72 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 298 aa  265  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 298 aa  265  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 298 aa  265  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 298 aa  265  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  48.74 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 298 aa  265  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 319 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  46.91 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  45.85 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  46.43 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  45.39 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  46.79 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 298 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 321 aa  262  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  45.49 
 
 		 323 aa  262  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  48.01 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  48.01 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 321 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 321 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 321 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 321 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  46.43 
 
 		 306 aa  260  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  44.41 
 
 		 323 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  46.35 
 
 		 289 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  47.65 
 
 		 321 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  45.39 
 
 		 323 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  45.04 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  45.39 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  47.65 
 
 		 289 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>