More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0399 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  100 
 
 		 283 aa  587  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3150  lipoyl synthase  69.53 
 
 		 283 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  69.53 
 
 		 291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  68.1 
 
 		 291 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0380  lipoyl synthase  68.21 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  63.7 
 
 		 281 aa  361  9e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2239  lipoyl synthase  63.44 
 
 		 280 aa  349  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  56.07 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  53.05 
 
 		 282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  53.28 
 
 		 283 aa  298  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  52 
 
 		 303 aa  292  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  52 
 
 		 303 aa  292  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  51.64 
 
 		 321 aa  292  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  53.45 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 325 aa  282  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 292 aa  282  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 289 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 314 aa  281  9e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  50 
 
 		 320 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  50 
 
 		 320 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  48.74 
 
 		 289 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 287 aa  279  4e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  49.45 
 
 		 288 aa  278  7e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  52 
 
 		 314 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  51.26 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  47.29 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  47.65 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  48.24 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  52.29 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  48.95 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 325 aa  272  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  48.72 
 
 		 297 aa  272  5.000000000000001e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  47.89 
 
 		 300 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 317 aa  271  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 332 aa  271  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  46.93 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  45.49 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 327 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  45.49 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 319 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  45.85 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  46.93 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 321 aa  270  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  46.43 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  49.63 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 332 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  48.07 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 339 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  48.57 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  48.57 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 339 aa  268  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 294 aa  268  8e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 334 aa  268  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  45.85 
 
 		 292 aa  268  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 332 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  46.93 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  46.76 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 304 aa  266  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1042  lipoyl synthase  49.27 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>