More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2239 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2239  lipoyl synthase  100 
 
 		 280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3150  lipoyl synthase  66.31 
 
 		 283 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  64.41 
 
 		 281 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  63.44 
 
 		 283 aa  362  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  62.55 
 
 		 291 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  62.18 
 
 		 291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0380  lipoyl synthase  63.21 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  53.41 
 
 		 283 aa  298  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 296 aa  292  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  51.28 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  51.28 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  49.08 
 
 		 282 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  50 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 324 aa  279  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  51.65 
 
 		 321 aa  278  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 325 aa  277  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 330 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  50 
 
 		 332 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  50.92 
 
 		 304 aa  276  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 330 aa  275  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  51.65 
 
 		 308 aa  275  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 326 aa  275  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 326 aa  275  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 329 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 329 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  50 
 
 		 325 aa  275  9e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 329 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  52.36 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  51.45 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  48.54 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  52 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  47.25 
 
 		 288 aa  272  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  47.12 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 333 aa  271  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  48.18 
 
 		 319 aa  271  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.55 
 
 		 318 aa  271  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 333 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 332 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 328 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  47.12 
 
 		 323 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  48.2 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  48.55 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  48.23 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  48.55 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  48.91 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  48.55 
 
 		 318 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  48.91 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  48.54 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  47.69 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  48 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  48 
 
 		 323 aa  268  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  47.89 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  46.89 
 
 		 299 aa  268  8e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  48 
 
 		 319 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  49.28 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>