More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0227 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  100 
 
 
288 aa  595  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  82.8 
 
 
290 aa  498  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  80.51 
 
 
299 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  68.12 
 
 
304 aa  407  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  64.24 
 
 
292 aa  394  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  61.37 
 
 
290 aa  360  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  61.15 
 
 
302 aa  356  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  60.87 
 
 
292 aa  354  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  57.25 
 
 
328 aa  348  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  57.25 
 
 
282 aa  337  9.999999999999999e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  55.6 
 
 
290 aa  332  4e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  54.74 
 
 
298 aa  332  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  56.12 
 
 
321 aa  329  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  54.32 
 
 
298 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  52.71 
 
 
303 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  52.71 
 
 
303 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  52.88 
 
 
308 aa  316  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  53.6 
 
 
298 aa  315  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  53.24 
 
 
298 aa  315  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  53.96 
 
 
298 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  53.24 
 
 
298 aa  315  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  53.24 
 
 
298 aa  315  8e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  53.24 
 
 
298 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  53.24 
 
 
298 aa  315  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  53.24 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  53.24 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  53.24 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  53.24 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  52.88 
 
 
298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 
321 aa  309  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  52.88 
 
 
305 aa  309  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  52.88 
 
 
305 aa  309  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  51.25 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  52.16 
 
 
304 aa  305  7e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  50 
 
 
300 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  49.1 
 
 
304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  50.18 
 
 
331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  52.35 
 
 
292 aa  298  5e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  50.36 
 
 
297 aa  296  4e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  50.72 
 
 
299 aa  295  6e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  47.67 
 
 
319 aa  295  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  51.26 
 
 
324 aa  294  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  50.36 
 
 
328 aa  294  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  48.91 
 
 
324 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50 
 
 
291 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.18 
 
 
282 aa  292  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  48.93 
 
 
335 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  48.04 
 
 
287 aa  291  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  48.73 
 
 
330 aa  291  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  48.36 
 
 
330 aa  291  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  48.73 
 
 
330 aa  291  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  48.73 
 
 
330 aa  291  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  48.73 
 
 
330 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  48.73 
 
 
330 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  48.57 
 
 
330 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  48.57 
 
 
334 aa  289  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  48.18 
 
 
325 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  49.64 
 
 
334 aa  289  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50.18 
 
 
351 aa  289  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  48.74 
 
 
337 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  48.36 
 
 
334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  48 
 
 
329 aa  288  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  48 
 
 
329 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  48 
 
 
329 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  49.27 
 
 
312 aa  287  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  48 
 
 
329 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  48.56 
 
 
288 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  45.88 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  45.88 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  45.2 
 
 
298 aa  286  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  45.88 
 
 
338 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  45.88 
 
 
338 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  47.64 
 
 
329 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  47.64 
 
 
329 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  47.64 
 
 
329 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  47.64 
 
 
329 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  47.29 
 
 
348 aa  285  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  45.52 
 
 
340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  49.64 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  49.64 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  49.45 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  49.82 
 
 
335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  49.45 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  49.45 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  47.97 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  47.45 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  49.45 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.12 
 
 
318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  45.88 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  48.38 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  49.29 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  49.09 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  49.64 
 
 
316 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  48.92 
 
 
326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  48.01 
 
 
350 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  47.12 
 
 
357 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  48.92 
 
 
296 aa  282  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  48.56 
 
 
287 aa  281  7.000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  49.64 
 
 
336 aa  281  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  45.88 
 
 
318 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>