More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1624 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  100 
 
 		 322 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  83.65 
 
 		 321 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  83.17 
 
 		 322 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  83.8 
 
 		 323 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  82.24 
 
 		 323 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  82.86 
 
 		 322 aa  560  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  82.55 
 
 		 323 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  81.37 
 
 		 323 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  79.3 
 
 		 319 aa  528  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  78.86 
 
 		 317 aa  528  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  77.81 
 
 		 320 aa  524  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  77.85 
 
 		 319 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  77.19 
 
 		 320 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  77.81 
 
 		 328 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  78.62 
 
 		 325 aa  518  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  76.45 
 
 		 327 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  77.53 
 
 		 319 aa  517  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  78.34 
 
 		 319 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  78.14 
 
 		 319 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  78.5 
 
 		 319 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  72.81 
 
 		 339 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  72.81 
 
 		 339 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  76.53 
 
 		 334 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  78.18 
 
 		 319 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  75.94 
 
 		 321 aa  511  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  75.71 
 
 		 317 aa  507  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  77.56 
 
 		 325 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  70.9 
 
 		 351 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  72.61 
 
 		 325 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  72.58 
 
 		 316 aa  475  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  72.26 
 
 		 315 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  71.94 
 
 		 330 aa  471  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  71.75 
 
 		 320 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  71.75 
 
 		 320 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  71.43 
 
 		 320 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  68.61 
 
 		 315 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  71.92 
 
 		 329 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  71.92 
 
 		 320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  67.44 
 
 		 314 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  65.67 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  68.04 
 
 		 311 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  66.55 
 
 		 287 aa  414  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  64.95 
 
 		 312 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  63.48 
 
 		 299 aa  403  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  63.14 
 
 		 297 aa  403  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  58.84 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  56.66 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  53.8 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  53.8 
 
 		 373 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  57.8 
 
 		 339 aa  332  5e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  57.8 
 
 		 318 aa  332  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  56.38 
 
 		 336 aa  328  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  55.16 
 
 		 331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  55.97 
 
 		 357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  56.94 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  56.74 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  55.16 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  56.74 
 
 		 332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  54.15 
 
 		 355 aa  325  9e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  55.91 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  55.16 
 
 		 333 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  54.91 
 
 		 296 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  56.03 
 
 		 331 aa  322  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  56.63 
 
 		 329 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  55.67 
 
 		 338 aa  322  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 329 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 329 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 329 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 329 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  54.8 
 
 		 333 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 330 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  55.67 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 329 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 329 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  53.99 
 
 		 283 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 329 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  55.91 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  56.27 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  55.91 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  55.56 
 
 		 335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 340 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  54.26 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  53.38 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  53.62 
 
 		 325 aa  316  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1961  lipoyl synthase  53.82 
 
 		 336 aa  316  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  54.61 
 
 		 326 aa  315  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  54.61 
 
 		 326 aa  315  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  53.93 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  53.12 
 
 		 320 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  54.29 
 
 		 321 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  54.35 
 
 		 292 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  54.29 
 
 		 332 aa  312  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0287  lipoyl synthase  54.12 
 
 		 314 aa  311  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0533885  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  53.57 
 
 		 321 aa  311  9e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  53.57 
 
 		 321 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>