More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0400 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  100 
 
 		 291 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  95.53 
 
 		 291 aa  568  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  69.53 
 
 		 283 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3150  lipoyl synthase  69.89 
 
 		 283 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  65.7 
 
 		 281 aa  359  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0380  lipoyl synthase  69.18 
 
 		 303 aa  358  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2239  lipoyl synthase  62.55 
 
 		 280 aa  344  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  53.26 
 
 		 283 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 291 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  50.36 
 
 		 328 aa  285  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  53.62 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  48.2 
 
 		 298 aa  281  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 321 aa  281  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 294 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 296 aa  279  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 320 aa  278  9e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  51.42 
 
 		 300 aa  278  9e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50.71 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50.71 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  47.52 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0381  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 297 aa  275  5e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.224918  hitchhiker  0.0000000000185759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  50.91 
 
 		 307 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  49.82 
 
 		 318 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  51.64 
 
 		 311 aa  275  9e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  46.79 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  48.26 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  47.27 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 321 aa  272  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  48.2 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  52 
 
 		 317 aa  271  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  52 
 
 		 317 aa  271  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0287  lipoyl synthase  49.3 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0533885  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  47.59 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  47.39 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  48.4 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  48.61 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  48.96 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  47.87 
 
 		 289 aa  269  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  48 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  47.55 
 
 		 304 aa  269  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 321 aa  268  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 321 aa  268  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  47.64 
 
 		 323 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  49.27 
 
 		 288 aa  268  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  46.52 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 321 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1961  lipoyl synthase  48.23 
 
 		 336 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  48 
 
 		 310 aa  266  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  49.3 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  47.87 
 
 		 288 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  48.03 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  48.03 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  47.27 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 315 aa  265  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  48.24 
 
 		 326 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  47.27 
 
 		 323 aa  265  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  46.93 
 
 		 355 aa  265  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 315 aa  265  5.999999999999999e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  47.84 
 
 		 333 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 311 aa  265  7e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  46.64 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 319 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  47.67 
 
 		 321 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>