More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1213 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  100 
 
 		 292 aa  608  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  70.91 
 
 		 294 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  66.91 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  64.62 
 
 		 300 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  61.09 
 
 		 291 aa  362  6e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  62.09 
 
 		 288 aa  359  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  59.36 
 
 		 292 aa  334  7.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 288 aa  311  6.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  54.58 
 
 		 328 aa  310  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  53.31 
 
 		 298 aa  308  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  53.17 
 
 		 298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  50 
 
 		 299 aa  305  7e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  52.9 
 
 		 299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 290 aa  302  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 304 aa  301  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  51.43 
 
 		 300 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  51.59 
 
 		 298 aa  299  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  53.24 
 
 		 283 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  51.81 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  51.61 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  296  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  50.69 
 
 		 298 aa  297  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  52.9 
 
 		 297 aa  296  4e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  295  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 321 aa  295  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  50 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 294 aa  291  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 321 aa  291  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  51.4 
 
 		 308 aa  291  8e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 292 aa  291  8e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  51.45 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 321 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  49.66 
 
 		 305 aa  289  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  49.66 
 
 		 305 aa  289  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 290 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  51.4 
 
 		 294 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 281 aa  289  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 321 aa  288  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 291 aa  288  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 321 aa  288  9e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 321 aa  288  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  51.23 
 
 		 327 aa  287  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 332 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  49.29 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  49.29 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 321 aa  285  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 310 aa  285  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  51.62 
 
 		 315 aa  285  7e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 321 aa  285  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  51.45 
 
 		 314 aa  285  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  51.62 
 
 		 315 aa  285  8e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  48.64 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.56 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0867  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.719819  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 325 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  50 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 368 aa  282  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  49.31 
 
 		 324 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 321 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  50 
 
 		 324 aa  281  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 321 aa  281  7.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 289 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19551  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 289 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  47.83 
 
 		 289 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  47.93 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>