More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07861 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  100 
 
 
290 aa  600  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  82.8 
 
 
288 aa  498  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  75.84 
 
 
299 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  66.3 
 
 
304 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  65.58 
 
 
292 aa  384  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  61.51 
 
 
290 aa  361  6e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  56.36 
 
 
328 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  60.85 
 
 
302 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  59.14 
 
 
292 aa  345  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  54.71 
 
 
282 aa  329  3e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  54.01 
 
 
298 aa  329  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  53.62 
 
 
290 aa  322  4e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.35 
 
 
321 aa  315  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50.9 
 
 
303 aa  315  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50.9 
 
 
303 aa  315  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  53.05 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  52.33 
 
 
298 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  49.29 
 
 
304 aa  308  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  49.45 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  51.07 
 
 
298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  48.96 
 
 
300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  51.07 
 
 
298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  50.71 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  50.71 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  50.71 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  50.71 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  50.71 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  50.18 
 
 
331 aa  301  8.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  50.71 
 
 
298 aa  301  9e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  50.71 
 
 
298 aa  301  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  50.71 
 
 
298 aa  301  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  50.36 
 
 
298 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.1 
 
 
308 aa  299  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  49.82 
 
 
294 aa  297  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  49.45 
 
 
330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  49.45 
 
 
330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  49.45 
 
 
330 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  49.09 
 
 
330 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  49.46 
 
 
304 aa  295  9e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  49.45 
 
 
330 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  49.45 
 
 
330 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  49.45 
 
 
330 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  49.09 
 
 
329 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  49.09 
 
 
329 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  49.09 
 
 
329 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  49.09 
 
 
329 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  49.45 
 
 
335 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  50.18 
 
 
328 aa  291  8e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  46.93 
 
 
319 aa  291  9e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  48.75 
 
 
305 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  48.75 
 
 
305 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  51.08 
 
 
292 aa  291  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  48.73 
 
 
329 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  48.73 
 
 
329 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  48.73 
 
 
329 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  48.73 
 
 
329 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  48.73 
 
 
334 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  48.36 
 
 
334 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  48.03 
 
 
350 aa  288  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  47.29 
 
 
348 aa  288  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  47.57 
 
 
321 aa  287  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  47.45 
 
 
325 aa  287  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  48.74 
 
 
282 aa  287  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  49.1 
 
 
332 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  48.55 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  46.57 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  48.35 
 
 
351 aa  285  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  47.65 
 
 
299 aa  285  7e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  48.57 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  47.84 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  47.29 
 
 
340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  47.65 
 
 
337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  47.99 
 
 
323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  46.18 
 
 
321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  46.93 
 
 
333 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  45.52 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  47.67 
 
 
357 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  48.19 
 
 
296 aa  281  9e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  45.68 
 
 
318 aa  281  9e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  49.64 
 
 
373 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  46.59 
 
 
331 aa  280  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  46.4 
 
 
321 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  49.64 
 
 
373 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  46.55 
 
 
297 aa  280  2e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  46.21 
 
 
330 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  47.84 
 
 
327 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  46.21 
 
 
331 aa  279  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  47.6 
 
 
311 aa  280  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  47.99 
 
 
323 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  45.99 
 
 
312 aa  279  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  45.52 
 
 
318 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  47.99 
 
 
323 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  46.93 
 
 
325 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  48.2 
 
 
326 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  46.55 
 
 
287 aa  278  6e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  47.31 
 
 
326 aa  278  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  47.29 
 
 
368 aa  278  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  47.31 
 
 
326 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  45.83 
 
 
321 aa  278  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  46.18 
 
 
321 aa  278  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>