More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1401 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  100 
 
 		 300 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2079  lipoyl synthase  78.11 
 
 		 298 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  71.83 
 
 		 291 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  63.93 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  57.55 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  60 
 
 		 296 aa  315  8e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  46.58 
 
 		 291 aa  300  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 282 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50 
 
 		 351 aa  285  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 306 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  46.23 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19551  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  51.43 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  48.96 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  48.96 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  46.62 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 321 aa  282  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  47.64 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  48.26 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 373 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 373 aa  279  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  46.83 
 
 		 302 aa  278  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 294 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  47.57 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3150  lipoyl synthase  52.08 
 
 		 283 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  51.42 
 
 		 291 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  45.82 
 
 		 322 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  45.82 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 291 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  48.08 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  48.08 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  45.88 
 
 		 288 aa  275  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  46.01 
 
 		 290 aa  275  8e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  46.5 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  49.13 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  46.39 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  50.52 
 
 		 320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  45.48 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0287  lipoyl synthase  48.06 
 
 		 314 aa  272  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0533885  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  45.94 
 
 		 280 aa  271  7e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  45.8 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  47.35 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  50.91 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  45.83 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  45.49 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  45.07 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  48.44 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  47.06 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 290 aa  268  8.999999999999999e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  46.71 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  50 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  47.57 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  46.26 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  51.96 
 
 		 292 aa  266  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  45.92 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2014  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.812557  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  45.55 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  46.45 
 
 		 355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  52.84 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  47.28 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  51.6 
 
 		 281 aa  265  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  46.28 
 
 		 333 aa  265  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  44.86 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  47.65 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  48.31 
 
 		 535 aa  265  7e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 329 aa  265  8e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 319 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  45.76 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 319 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  45.21 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  44.98 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  47.52 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  46.88 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  46.44 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  44.9 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  44.14 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  45.83 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  45.58 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  45.58 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  45.64 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  45.33 
 
 		 318 aa  261  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  43.79 
 
 		 347 aa  261  8e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  44.41 
 
 		 333 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  44.56 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>