More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2751 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  100 
 
 
351 aa  723    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  76.64 
 
 
321 aa  514  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  79.28 
 
 
325 aa  514  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  70.25 
 
 
322 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  70.4 
 
 
323 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  72.14 
 
 
321 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  69.94 
 
 
322 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  71.34 
 
 
323 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  73.07 
 
 
317 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  72.15 
 
 
325 aa  488  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  70.4 
 
 
323 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  70.09 
 
 
323 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  71.25 
 
 
325 aa  481  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  70.9 
 
 
322 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  70.4 
 
 
320 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  72.67 
 
 
320 aa  474  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  76.43 
 
 
329 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  77.1 
 
 
320 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  69.44 
 
 
327 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  71.34 
 
 
334 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  70.51 
 
 
339 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  69.33 
 
 
319 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  70.51 
 
 
339 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  70.13 
 
 
319 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  72.91 
 
 
328 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  68.52 
 
 
319 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  68.21 
 
 
319 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  69.14 
 
 
319 aa  461  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  66.67 
 
 
317 aa  460  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  72.31 
 
 
316 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  69.3 
 
 
319 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  70.96 
 
 
315 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  69.3 
 
 
319 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  71.33 
 
 
320 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  70.76 
 
 
320 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  69.64 
 
 
315 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  70.2 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  70.76 
 
 
320 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  69.54 
 
 
314 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  66.22 
 
 
310 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  68.4 
 
 
311 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  66.55 
 
 
287 aa  409  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  65.53 
 
 
312 aa  408  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  63.41 
 
 
297 aa  399  9.999999999999999e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  62.02 
 
 
299 aa  390  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  60.84 
 
 
296 aa  363  3e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  54.08 
 
 
355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  54.64 
 
 
321 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  52.96 
 
 
318 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  54.39 
 
 
327 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  57.76 
 
 
330 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  57.76 
 
 
330 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  57.76 
 
 
330 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  57.4 
 
 
330 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  57.4 
 
 
330 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  57.4 
 
 
330 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  56.93 
 
 
328 aa  322  7e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  57.04 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  57.04 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  57.04 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  57.04 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  55.52 
 
 
324 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  54.8 
 
 
319 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  54.96 
 
 
373 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  56.68 
 
 
329 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  56.68 
 
 
329 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  56.68 
 
 
329 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  56.68 
 
 
329 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  54.96 
 
 
373 aa  318  6e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  56.93 
 
 
311 aa  318  7e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  56.68 
 
 
330 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  48.26 
 
 
347 aa  318  9e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  52.77 
 
 
337 aa  318  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  56.58 
 
 
294 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  55.43 
 
 
297 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  55.12 
 
 
318 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  56.23 
 
 
339 aa  315  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  50.63 
 
 
347 aa  316  5e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  50.63 
 
 
347 aa  316  5e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  55.43 
 
 
309 aa  315  6e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  56.43 
 
 
318 aa  315  8e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  52.11 
 
 
282 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  49.85 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  55.33 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  55.52 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  54.45 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  55.12 
 
 
325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  55.52 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0287  lipoyl synthase  53.56 
 
 
314 aa  312  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0533885  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  52.49 
 
 
320 aa  312  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  53.82 
 
 
298 aa  311  9e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  55.96 
 
 
334 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  52.7 
 
 
338 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  55.16 
 
 
324 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  55.96 
 
 
335 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  52.7 
 
 
338 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  52.7 
 
 
338 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  50.91 
 
 
335 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  52.7 
 
 
338 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  51.35 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>