More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3382 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  100 
 
 		 288 aa  595  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  58.33 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  55.56 
 
 		 307 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  52 
 
 		 282 aa  308  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  56.36 
 
 		 318 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  53.74 
 
 		 283 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  54.12 
 
 		 321 aa  299  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  56.12 
 
 		 337 aa  298  6e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 294 aa  298  9e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  53.74 
 
 		 304 aa  298  9e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  51.4 
 
 		 300 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  51.05 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  53.28 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  52.1 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  53.07 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  53.28 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  52.33 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  53.6 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  51.82 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  291  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 297 aa  291  6e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  52.45 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  52.84 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  53.24 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  53.19 
 
 		 321 aa  289  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  53.68 
 
 		 322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3006  lipoyl synthase  50 
 
 		 305 aa  287  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1398  lipoyl synthase  51.74 
 
 		 299 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 317 aa  287  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  51.61 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  52.71 
 
 		 320 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 319 aa  285  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 320 aa  285  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  52.86 
 
 		 321 aa  285  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 323 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 321 aa  284  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  52.14 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  49.12 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  51.22 
 
 		 324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  52.14 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  52.5 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  50.87 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  51.62 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  51.62 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09741  lipoyl synthase  48.61 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  51.26 
 
 		 321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  52.5 
 
 		 321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  51.43 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  49.27 
 
 		 287 aa  281  6.000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  50.71 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  53.21 
 
 		 321 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 325 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  48.74 
 
 		 322 aa  281  8.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  48.41 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 311 aa  281  9e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  53.21 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  48.74 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  51.05 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  50.55 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  51.58 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  51.26 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  51.26 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 321 aa  279  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  50.54 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  50.54 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 314 aa  279  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  52.14 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 281 aa  279  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  51.45 
 
 		 297 aa  279  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  278  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  278  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  278  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  278  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 298 aa  278  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  52.5 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 283 aa  278  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  50.55 
 
 		 320 aa  278  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  56.13 
 
 		 276 aa  278  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  50.55 
 
 		 300 aa  278  8e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3493  lipoyl synthase  48.64 
 
 		 307 aa  278  8e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>