More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1277 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  100 
 
 		 287 aa  599  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  66.55 
 
 		 294 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  65.72 
 
 		 300 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  66.91 
 
 		 292 aa  374  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  61.45 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  61.59 
 
 		 288 aa  358  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  61.59 
 
 		 292 aa  343  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 355 aa  292  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 304 aa  292  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 292 aa  292  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 288 aa  291  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 321 aa  291  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  49.82 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 315 aa  289  3e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 315 aa  289  3e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 290 aa  289  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 297 aa  289  5.0000000000000004e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  288  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 292 aa  288  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 337 aa  287  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 320 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  48.57 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  48.57 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  46.57 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 299 aa  286  4e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 282 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  285  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 324 aa  285  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 321 aa  285  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 299 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0867  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.719819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 306 aa  282  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 321 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 305 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 305 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 304 aa  280  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 322 aa  280  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 321 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  47.64 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  45.45 
 
 		 282 aa  279  3e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  46.95 
 
 		 340 aa  279  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  46.1 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  49.27 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  46.1 
 
 		 338 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  47.48 
 
 		 321 aa  278  5e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  46.1 
 
 		 338 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  46.1 
 
 		 338 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 322 aa  278  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 321 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.29 
 
 		 318 aa  278  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  47.83 
 
 		 291 aa  278  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  47.33 
 
 		 315 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  47.65 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  47.14 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 325 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  46.21 
 
 		 347 aa  276  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  48.2 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  48.03 
 
 		 337 aa  276  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  46.21 
 
 		 347 aa  276  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  47.1 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  47.48 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  51.5 
 
 		 276 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>