More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2644 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  100 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  60.95 
 
 		 303 aa  332  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  60.95 
 
 		 303 aa  332  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  59.04 
 
 		 321 aa  329  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  59.93 
 
 		 308 aa  326  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  58.3 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  56.09 
 
 		 298 aa  311  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  56.09 
 
 		 298 aa  311  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  56.09 
 
 		 298 aa  311  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  56.09 
 
 		 298 aa  311  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  56.09 
 
 		 298 aa  310  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  56.09 
 
 		 298 aa  310  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  56.09 
 
 		 298 aa  310  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  56.46 
 
 		 298 aa  310  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  56.09 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  56.09 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  57.63 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  55.97 
 
 		 298 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  53.96 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  52.59 
 
 		 304 aa  298  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  55.56 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  55.15 
 
 		 304 aa  298  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  54.17 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  54.72 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  55.21 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  52.75 
 
 		 298 aa  292  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  53.36 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  53.36 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  54.17 
 
 		 309 aa  284  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  53.99 
 
 		 355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  54.51 
 
 		 318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  52.43 
 
 		 314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  51.31 
 
 		 297 aa  281  7.000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  52.27 
 
 		 294 aa  281  7.000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  55.35 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  51.11 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  51.31 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  51.26 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  53.56 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 299 aa  279  3e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  50 
 
 		 280 aa  279  3e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  53.28 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  50.37 
 
 		 292 aa  278  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  56.13 
 
 		 288 aa  278  6e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  52.63 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  52.06 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  51.09 
 
 		 304 aa  278  9e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  50.93 
 
 		 311 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  51.11 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  55.3 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  55.3 
 
 		 315 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  51.5 
 
 		 337 aa  276  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  50 
 
 		 292 aa  276  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  51.5 
 
 		 287 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  53.9 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  53.9 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 287 aa  275  8e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  50 
 
 		 300 aa  275  8e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  51.71 
 
 		 314 aa  274  9e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  50.94 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  52.57 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  50.97 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  53.01 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  50 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  52.81 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  50.92 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  52.42 
 
 		 294 aa  272  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  49.63 
 
 		 290 aa  272  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  52.81 
 
 		 337 aa  271  6e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  271  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  50.94 
 
 		 285 aa  271  8.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  51.11 
 
 		 335 aa  271  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  50.94 
 
 		 329 aa  271  9e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  55.95 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  50 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  50 
 
 		 319 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  50.38 
 
 		 332 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  51.3 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  51.3 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  45.76 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  51.3 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0287  lipoyl synthase  50.37 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0533885  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  51.3 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  51.3 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  48.72 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  50.92 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  51.3 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  51.3 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  51.3 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  51.3 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  50.37 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  50.75 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  50.94 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  50.91 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  50.93 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  52.59 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  51.5 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  50.93 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  50.93 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>