More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0511 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  100 
 
 		 304 aa  634    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  95.72 
 
 		 305 aa  614  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  95.72 
 
 		 305 aa  614  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  79.73 
 
 		 298 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  79.6 
 
 		 298 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  77.16 
 
 		 298 aa  482  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  75.84 
 
 		 298 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  75.84 
 
 		 298 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  77.16 
 
 		 298 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  75.5 
 
 		 298 aa  481  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  75.84 
 
 		 298 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  75.84 
 
 		 298 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  77.16 
 
 		 298 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  75.5 
 
 		 298 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  75.5 
 
 		 298 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  76.47 
 
 		 298 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  66.19 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  56.23 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  54.8 
 
 		 303 aa  326  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  54.8 
 
 		 303 aa  326  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  53.63 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  53.63 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  53.63 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  53.05 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  52.76 
 
 		 321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  52.52 
 
 		 299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1042  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 301 aa  305  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  50 
 
 		 292 aa  305  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  52.16 
 
 		 288 aa  305  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  50.36 
 
 		 302 aa  305  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  51.23 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  52.33 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  52.48 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  51.9 
 
 		 321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  50 
 
 		 290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  52.33 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  52.25 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  53.07 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  52.25 
 
 		 321 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 299 aa  301  9e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  52.25 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  52.25 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  52.25 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  52.25 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  52.25 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  51.38 
 
 		 321 aa  300  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  52.25 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  52.25 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  52.25 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  51.02 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  52.25 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  51.9 
 
 		 321 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  52.82 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  53.17 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  50.33 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  51.61 
 
 		 287 aa  299  5e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  51.9 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  51.42 
 
 		 329 aa  298  8e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  50.34 
 
 		 322 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  54.18 
 
 		 283 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  51.03 
 
 		 321 aa  297  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  52.69 
 
 		 351 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  50.34 
 
 		 322 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 292 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 320 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  50.52 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  52.26 
 
 		 314 aa  296  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  52.69 
 
 		 331 aa  296  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  51.03 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  50 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  51.74 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  49.14 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 306 aa  295  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 298 aa  296  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  50 
 
 		 323 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  50 
 
 		 312 aa  295  5e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  52.16 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  48.97 
 
 		 320 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  50.87 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  48.97 
 
 		 320 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  51.39 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  51.39 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  51.39 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  51.39 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 290 aa  295  9e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  51.62 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  51.39 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  51.39 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  51.39 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  51.74 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  54.72 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  47.55 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  49.83 
 
 		 321 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  51.42 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>