More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3791 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  100 
 
 		 350 aa  726    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  77.43 
 
 		 368 aa  552  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  76.99 
 
 		 348 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  66.77 
 
 		 329 aa  454  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  67.39 
 
 		 329 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  67.71 
 
 		 331 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  64.92 
 
 		 334 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  61.49 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  64.16 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  61.19 
 
 		 335 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  54.64 
 
 		 294 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  54.93 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  54.93 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  54.58 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  52.63 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  52.61 
 
 		 296 aa  309  4e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 297 aa  305  7e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  53.09 
 
 		 308 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  50.34 
 
 		 314 aa  303  4.0000000000000003e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.63 
 
 		 321 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  52.46 
 
 		 308 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  53.07 
 
 		 304 aa  302  7.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  52.71 
 
 		 305 aa  302  7.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  52.71 
 
 		 305 aa  302  7.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  51.71 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  54.01 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  48.96 
 
 		 413 aa  296  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  50.17 
 
 		 399 aa  295  6e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 312 aa  295  8e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 321 aa  295  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 351 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  49.82 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  51.62 
 
 		 298 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  51.62 
 
 		 298 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 287 aa  292  5e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  48.8 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 323 aa  289  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 290 aa  288  9e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 292 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  46.2 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  46.2 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 		 303 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 		 303 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  286  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 292 aa  285  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  46.77 
 
 		 320 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  46.13 
 
 		 401 aa  285  8e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  50.33 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  51.62 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  48.74 
 
 		 290 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  48.59 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  45.77 
 
 		 318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 298 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  45.6 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 288 aa  282  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 298 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 298 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 298 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  46.2 
 
 		 321 aa  282  7.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  45.57 
 
 		 321 aa  282  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 298 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 298 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  46.67 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  45.57 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  45.57 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  46.67 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  46.67 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 298 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  45.57 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 298 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  46.96 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  47.15 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  45.37 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 298 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>