More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28652 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  100 
 
 
314 aa  659    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  60.93 
 
 
398 aa  385  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  59.15 
 
 
413 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  59.62 
 
 
324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  55.49 
 
 
401 aa  354  8.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  56.35 
 
 
395 aa  354  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  56.49 
 
 
399 aa  350  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  54.05 
 
 
294 aa  338  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  52.67 
 
 
326 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  52.67 
 
 
326 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  52.67 
 
 
326 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  53.74 
 
 
324 aa  326  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  52.38 
 
 
335 aa  320  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  53.33 
 
 
308 aa  318  7e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  52.76 
 
 
348 aa  316  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  50.8 
 
 
312 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  52.76 
 
 
329 aa  308  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  52.07 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  52.41 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  50.34 
 
 
350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  50.32 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  51.71 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  50.34 
 
 
331 aa  295  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  48.61 
 
 
334 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  48.48 
 
 
291 aa  285  7e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1669  lipoic acid synthetase  49.19 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  47.75 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3599  lipoic acid synthetase  48.39 
 
 
320 aa  282  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  47.67 
 
 
285 aa  280  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  48.28 
 
 
308 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  48.45 
 
 
296 aa  276  4e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  45.85 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  43.59 
 
 
299 aa  269  5e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  44.33 
 
 
310 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  45.76 
 
 
311 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  44.06 
 
 
289 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  47.24 
 
 
312 aa  265  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  45.99 
 
 
314 aa  265  8.999999999999999e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  45.89 
 
 
325 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  46.13 
 
 
311 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  43.71 
 
 
289 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  48.1 
 
 
327 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  45.83 
 
 
282 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  44.06 
 
 
306 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  50 
 
 
355 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  43.01 
 
 
294 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  47.22 
 
 
298 aa  261  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  45.3 
 
 
321 aa  261  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  45.3 
 
 
321 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  43.69 
 
 
287 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  47.93 
 
 
373 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  46.34 
 
 
330 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  44.71 
 
 
300 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  44.95 
 
 
321 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  47.93 
 
 
373 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  44.83 
 
 
303 aa  259  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  42.71 
 
 
297 aa  259  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  44.83 
 
 
303 aa  259  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  46.23 
 
 
320 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  42.86 
 
 
321 aa  259  6e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0381  lipoyl synthase  46.9 
 
 
297 aa  258  6e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.224918  hitchhiker  0.0000000000185759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  46.26 
 
 
296 aa  259  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  45.3 
 
 
321 aa  258  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  44.25 
 
 
321 aa  258  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  41.39 
 
 
292 aa  258  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  44.25 
 
 
321 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  44.25 
 
 
321 aa  258  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  44.25 
 
 
321 aa  258  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  44.25 
 
 
321 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  44.25 
 
 
321 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  43.25 
 
 
320 aa  258  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  44.25 
 
 
321 aa  258  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  44.25 
 
 
321 aa  258  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  44.25 
 
 
321 aa  258  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  44.6 
 
 
321 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0287  lipoyl synthase  45.17 
 
 
314 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0533885  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  45.99 
 
 
330 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  45.33 
 
 
321 aa  257  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  45.64 
 
 
334 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  45.99 
 
 
330 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  45.99 
 
 
330 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  43.99 
 
 
316 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  46.34 
 
 
309 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  45.99 
 
 
329 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  45.99 
 
 
330 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  45.99 
 
 
330 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  44.25 
 
 
321 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  45.33 
 
 
321 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  45.99 
 
 
330 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  44.06 
 
 
291 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  44.29 
 
 
321 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  45.3 
 
 
329 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  44.48 
 
 
283 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  46.74 
 
 
337 aa  256  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  43.3 
 
 
320 aa  255  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  45.24 
 
 
320 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0847  lipoyl synthase  45.52 
 
 
308 aa  255  6e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>