More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18029 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  100 
 
 
401 aa  835    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  59.63 
 
 
413 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  54.08 
 
 
398 aa  395  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  61.11 
 
 
399 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  51.29 
 
 
395 aa  376  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  53.73 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  55.49 
 
 
314 aa  336  5e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  54.43 
 
 
294 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  48.82 
 
 
326 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  48.82 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  48.53 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  54.28 
 
 
308 aa  326  5e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  52.44 
 
 
311 aa  318  7.999999999999999e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  52.84 
 
 
324 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  50.31 
 
 
329 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  50 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  50.48 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  51.14 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  50.85 
 
 
334 aa  301  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  50.51 
 
 
348 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3599  lipoic acid synthetase  51.13 
 
 
320 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1669  lipoic acid synthetase  50.49 
 
 
321 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  50.79 
 
 
328 aa  298  9e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  48.82 
 
 
368 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  48.73 
 
 
331 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  50.33 
 
 
291 aa  292  9e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  47.8 
 
 
285 aa  290  2e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  49.5 
 
 
296 aa  287  2e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  46.13 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  47.8 
 
 
321 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  45.62 
 
 
304 aa  273  6e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  46.8 
 
 
297 aa  272  7e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  45.31 
 
 
305 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  45.31 
 
 
305 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  46.46 
 
 
299 aa  271  2e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  47.35 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  48.67 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  47.65 
 
 
288 aa  269  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  45.31 
 
 
329 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  45.31 
 
 
329 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  45.31 
 
 
329 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  45.31 
 
 
329 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  45.31 
 
 
329 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  45.31 
 
 
329 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  46.78 
 
 
291 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  45.31 
 
 
329 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  47.18 
 
 
326 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  46.8 
 
 
287 aa  266  4e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  44.92 
 
 
298 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  44.01 
 
 
303 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  44.01 
 
 
303 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  47.78 
 
 
308 aa  265  7e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  45 
 
 
329 aa  265  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  46.13 
 
 
355 aa  265  8e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  44.38 
 
 
330 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  45.64 
 
 
299 aa  264  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  45.34 
 
 
320 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  44.38 
 
 
330 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  44.24 
 
 
330 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  44.38 
 
 
330 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  45.34 
 
 
320 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  46.75 
 
 
311 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  46.67 
 
 
315 aa  263  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  44.38 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  45.05 
 
 
321 aa  262  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  44.38 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  44.38 
 
 
330 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  45.24 
 
 
290 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  45.14 
 
 
322 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  45.63 
 
 
323 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  43.73 
 
 
325 aa  259  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  46.8 
 
 
328 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  46.94 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  41.74 
 
 
339 aa  259  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  45.31 
 
 
321 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  45.29 
 
 
320 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  44.48 
 
 
334 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  44.62 
 
 
330 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  43.48 
 
 
318 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  44.34 
 
 
322 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  42.65 
 
 
331 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  46.31 
 
 
320 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  43.85 
 
 
334 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  44.16 
 
 
335 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  42.23 
 
 
330 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  46.13 
 
 
298 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  44.27 
 
 
340 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  45.31 
 
 
325 aa  256  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  43.89 
 
 
323 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  45.61 
 
 
304 aa  255  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  43.48 
 
 
333 aa  255  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  44.3 
 
 
315 aa  255  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  44.68 
 
 
373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  43.89 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  44.13 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  44.14 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  44.01 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  46.1 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  46.1 
 
 
298 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  45.31 
 
 
321 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>