More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL04340 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  815    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  64 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  57.65 
 
 
398 aa  422  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  57.82 
 
 
399 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  51.13 
 
 
401 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  56.27 
 
 
314 aa  343  4e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  54.21 
 
 
294 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  54.24 
 
 
308 aa  318  7.999999999999999e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  56.61 
 
 
324 aa  315  6e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  53 
 
 
312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  52.88 
 
 
326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  52.54 
 
 
326 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  52.54 
 
 
326 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  51.67 
 
 
311 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  52.72 
 
 
348 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  53.63 
 
 
324 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3599  lipoic acid synthetase  49.69 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  51.71 
 
 
350 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  50.17 
 
 
335 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1669  lipoic acid synthetase  50.33 
 
 
321 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  53.26 
 
 
329 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  50.47 
 
 
368 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  52.58 
 
 
329 aa  292  5e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  51.54 
 
 
331 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  51.03 
 
 
328 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  51.89 
 
 
296 aa  282  9e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  47.71 
 
 
297 aa  277  3e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  48.15 
 
 
291 aa  273  3e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  47.39 
 
 
299 aa  271  1e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  48.97 
 
 
334 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  50.7 
 
 
321 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  47.62 
 
 
320 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  46.05 
 
 
320 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  46.05 
 
 
320 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  44.26 
 
 
311 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  45.55 
 
 
337 aa  264  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  45.58 
 
 
330 aa  263  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  49.81 
 
 
285 aa  261  1e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  44.88 
 
 
305 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  44.88 
 
 
305 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  44.97 
 
 
304 aa  260  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  44.59 
 
 
316 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  43.88 
 
 
315 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  47.46 
 
 
355 aa  260  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  44.05 
 
 
315 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  47.26 
 
 
298 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  45.33 
 
 
321 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  44.64 
 
 
310 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  42.81 
 
 
314 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  46.6 
 
 
303 aa  255  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  46.6 
 
 
303 aa  255  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  44.84 
 
 
321 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  41.82 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  45.08 
 
 
340 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  45.55 
 
 
298 aa  253  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  45.11 
 
 
319 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  45.55 
 
 
298 aa  252  7e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  46.03 
 
 
308 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  47.39 
 
 
298 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  44.13 
 
 
319 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  45.12 
 
 
323 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  45.21 
 
 
298 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  45.21 
 
 
298 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  45.21 
 
 
298 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  45.21 
 
 
298 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  44.78 
 
 
327 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  45.21 
 
 
298 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  45.21 
 
 
298 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  45.21 
 
 
298 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  45.3 
 
 
325 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  45.21 
 
 
298 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  45.21 
 
 
298 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  45.61 
 
 
287 aa  249  5e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  44.07 
 
 
338 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  47.72 
 
 
315 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  43.42 
 
 
317 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  47.72 
 
 
315 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  44.79 
 
 
312 aa  247  3e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  44.07 
 
 
335 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  46.42 
 
 
304 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  46.15 
 
 
330 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  44.75 
 
 
325 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  42.11 
 
 
292 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  43.73 
 
 
338 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  42.45 
 
 
347 aa  246  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  45.89 
 
 
302 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  47.27 
 
 
296 aa  246  4e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  46.5 
 
 
330 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  46.5 
 
 
330 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  43.73 
 
 
338 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  47.74 
 
 
327 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  46.5 
 
 
330 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  46.15 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  46.37 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  46.15 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  45.39 
 
 
324 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  43.09 
 
 
319 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  46.15 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  43.39 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  45.33 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>