More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86231 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  100 
 
 
398 aa  824    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  67.87 
 
 
413 aa  498  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  59.15 
 
 
395 aa  420  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  54.08 
 
 
401 aa  395  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  58.36 
 
 
399 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  60.93 
 
 
314 aa  368  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  56.62 
 
 
324 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  53.42 
 
 
294 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  54.05 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  51.38 
 
 
326 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  55.33 
 
 
308 aa  318  7.999999999999999e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  51.38 
 
 
326 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  51.38 
 
 
326 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  51.42 
 
 
324 aa  316  5e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  50 
 
 
335 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  52.43 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  53.31 
 
 
368 aa  311  9e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  52.63 
 
 
350 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  50.78 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  50.78 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  50.99 
 
 
311 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  53.17 
 
 
328 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3599  lipoic acid synthetase  51.85 
 
 
320 aa  296  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  50.17 
 
 
334 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1669  lipoic acid synthetase  50.34 
 
 
321 aa  291  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  49.32 
 
 
331 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  50.52 
 
 
291 aa  281  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  48.33 
 
 
321 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  49.82 
 
 
296 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  47.49 
 
 
305 aa  272  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  47.49 
 
 
305 aa  272  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  48.46 
 
 
298 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  46.49 
 
 
310 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  47.02 
 
 
304 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  48.44 
 
 
298 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  47.86 
 
 
321 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  44.83 
 
 
285 aa  269  7e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  46.48 
 
 
296 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  48.25 
 
 
373 aa  266  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  46.6 
 
 
321 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  45.34 
 
 
325 aa  265  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  48.25 
 
 
373 aa  266  7e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  47.52 
 
 
299 aa  265  1e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  47.16 
 
 
297 aa  265  1e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  44.74 
 
 
330 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  47.32 
 
 
320 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  47.32 
 
 
320 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  46.03 
 
 
325 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  43.09 
 
 
315 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  46.67 
 
 
311 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  48.76 
 
 
319 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  46.98 
 
 
320 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  47.16 
 
 
290 aa  261  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  48.25 
 
 
327 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  45.95 
 
 
328 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  46 
 
 
298 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  44.98 
 
 
319 aa  260  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  44.41 
 
 
322 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  45.83 
 
 
291 aa  259  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  47.86 
 
 
311 aa  259  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  46.71 
 
 
307 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  46.48 
 
 
325 aa  259  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  48.2 
 
 
308 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  47.3 
 
 
326 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  46.42 
 
 
298 aa  259  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  44.66 
 
 
319 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  45.25 
 
 
316 aa  258  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  44.14 
 
 
312 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  49.46 
 
 
309 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  45.33 
 
 
298 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  45.33 
 
 
298 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  45.33 
 
 
298 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  46.34 
 
 
351 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  45.45 
 
 
355 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  46.64 
 
 
298 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  46.85 
 
 
336 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  45.74 
 
 
321 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  46.64 
 
 
298 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  43.93 
 
 
322 aa  256  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  46.64 
 
 
298 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  44.7 
 
 
315 aa  256  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  45.04 
 
 
282 aa  255  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  46.64 
 
 
298 aa  255  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  46.64 
 
 
298 aa  255  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  46.64 
 
 
298 aa  255  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  45.07 
 
 
283 aa  255  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  46.64 
 
 
298 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  44.98 
 
 
319 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  45.94 
 
 
319 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  48.23 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  45.79 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0847  lipoyl synthase  43.15 
 
 
308 aa  253  3e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  44.93 
 
 
339 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  45.74 
 
 
287 aa  253  3e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  47.12 
 
 
324 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  44.66 
 
 
319 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  46.13 
 
 
318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  42.86 
 
 
297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  44.66 
 
 
319 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  42.86 
 
 
323 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>