More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1184 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  100 
 
 		 296 aa  590  1e-167  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  66.79 
 
 		 291 aa  390  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  52.61 
 
 		 350 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  55.71 
 
 		 324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  56.23 
 
 		 334 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  55.21 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  52.26 
 
 		 329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  56.06 
 
 		 285 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  52.26 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  56.79 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  56.79 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  54.12 
 
 		 328 aa  302  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  56.79 
 
 		 326 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  56.43 
 
 		 326 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  52.76 
 
 		 368 aa  295  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  53.26 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50.87 
 
 		 291 aa  291  7e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  50.87 
 
 		 348 aa  290  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  53.74 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  52.14 
 
 		 308 aa  287  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  49.5 
 
 		 401 aa  286  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  54.68 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  54.68 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 288 aa  282  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  51.89 
 
 		 395 aa  281  9e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 282 aa  281  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 290 aa  281  9e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.42 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  51.05 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  48.07 
 
 		 287 aa  279  5e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 298 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  52.78 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  50 
 
 		 318 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  51.03 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  51.03 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  51.03 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  50 
 
 		 310 aa  275  7e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  49.48 
 
 		 309 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  51.4 
 
 		 311 aa  275  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  50 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  53.66 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  51.94 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  49.65 
 
 		 399 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  49.82 
 
 		 398 aa  273  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  53.26 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  48.45 
 
 		 314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  49.48 
 
 		 413 aa  272  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 307 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 282 aa  271  7e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  45.91 
 
 		 280 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  51.81 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  52.17 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  269  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 315 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 305 aa  268  8e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 305 aa  268  8e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 312 aa  268  8.999999999999999e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 320 aa  267  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 355 aa  267  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  45.67 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  48.78 
 
 		 300 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 330 aa  266  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  47.59 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  48.07 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  48.25 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  50.53 
 
 		 337 aa  265  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  46.98 
 
 		 347 aa  265  5e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  49.13 
 
 		 332 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  48.43 
 
 		 300 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  49.31 
 
 		 351 aa  265  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 317 aa  265  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 338 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  46.98 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  46.98 
 
 		 347 aa  264  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>