More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0833 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  100 
 
 
335 aa  694    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  83.23 
 
 
324 aa  556  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  66.08 
 
 
348 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  58.96 
 
 
368 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  58.36 
 
 
334 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  61.19 
 
 
350 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  60.34 
 
 
329 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  60 
 
 
329 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  59.8 
 
 
328 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  58.15 
 
 
331 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  57.79 
 
 
326 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  57.44 
 
 
326 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  57.44 
 
 
326 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  54.3 
 
 
413 aa  323  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  56.79 
 
 
294 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  50 
 
 
398 aa  315  9e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  53.85 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  55.32 
 
 
291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  56.68 
 
 
303 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  56.68 
 
 
303 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  56.43 
 
 
321 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  52.38 
 
 
314 aa  310  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  50.48 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  55.21 
 
 
296 aa  306  3e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  54.68 
 
 
285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  51.6 
 
 
297 aa  301  1e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  50.18 
 
 
299 aa  298  1e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  51.52 
 
 
399 aa  298  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  52.9 
 
 
308 aa  297  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  49.48 
 
 
310 aa  296  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  51.19 
 
 
395 aa  295  6e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  52.67 
 
 
324 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  53.07 
 
 
309 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  53.19 
 
 
317 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  53.19 
 
 
317 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  52.5 
 
 
320 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  51.8 
 
 
320 aa  291  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  49.68 
 
 
329 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  52.26 
 
 
311 aa  289  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  50.16 
 
 
328 aa  288  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  49.83 
 
 
351 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  50.71 
 
 
330 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  50.71 
 
 
311 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  50.18 
 
 
287 aa  287  2e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  53.24 
 
 
308 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  48.53 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  48.53 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  51.21 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  48.72 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  52.14 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 
318 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  48.96 
 
 
321 aa  285  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  53.54 
 
 
296 aa  285  1.0000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  51.43 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  44.98 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  49.82 
 
 
288 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  49.64 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  50.54 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  51.39 
 
 
320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  51.61 
 
 
322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  50 
 
 
321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  50.7 
 
 
336 aa  282  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  48.81 
 
 
373 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  50 
 
 
321 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  48.81 
 
 
373 aa  282  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  49.64 
 
 
355 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  52.16 
 
 
298 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  48.08 
 
 
321 aa  281  8.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  49.16 
 
 
340 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  48.08 
 
 
321 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  48.08 
 
 
321 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  48.43 
 
 
338 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  50.69 
 
 
321 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  48.08 
 
 
321 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  48.08 
 
 
321 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  48.08 
 
 
321 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  50.18 
 
 
327 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  50.71 
 
 
298 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  50.71 
 
 
315 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  48.43 
 
 
338 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  47.45 
 
 
321 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  50.34 
 
 
304 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  50.36 
 
 
298 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  50.36 
 
 
298 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  50.36 
 
 
298 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  50.36 
 
 
298 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  50.36 
 
 
298 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  50.36 
 
 
298 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  48.08 
 
 
321 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  48.08 
 
 
321 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  52.16 
 
 
337 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  50.36 
 
 
298 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  46.36 
 
 
314 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  50.54 
 
 
304 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  48.43 
 
 
338 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  48.43 
 
 
338 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  50.36 
 
 
298 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  50.71 
 
 
316 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  48.08 
 
 
321 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  50.71 
 
 
298 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>