More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0322 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  100 
 
 
296 aa  613  9.999999999999999e-175  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  64.44 
 
 
287 aa  377  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  63.04 
 
 
299 aa  375  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  62.33 
 
 
321 aa  374  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  62.41 
 
 
297 aa  372  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  61.19 
 
 
317 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  62.02 
 
 
327 aa  367  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  62.68 
 
 
319 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  62.86 
 
 
325 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  62.99 
 
 
319 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  61.25 
 
 
310 aa  364  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  58.84 
 
 
322 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  59.58 
 
 
315 aa  364  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  60.98 
 
 
334 aa  364  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  60.34 
 
 
323 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  60.63 
 
 
339 aa  363  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  60.84 
 
 
351 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  63 
 
 
329 aa  362  4e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  60.63 
 
 
339 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  60.14 
 
 
325 aa  362  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  61.05 
 
 
320 aa  361  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  58.97 
 
 
320 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  62.64 
 
 
320 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  59.86 
 
 
323 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  59.51 
 
 
323 aa  359  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  60.35 
 
 
320 aa  359  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  58.08 
 
 
322 aa  358  5e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  57.73 
 
 
321 aa  358  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  59.86 
 
 
323 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  58.08 
 
 
322 aa  358  7e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  59.52 
 
 
315 aa  358  7e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  61.37 
 
 
319 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  58.89 
 
 
316 aa  357  9e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  61.89 
 
 
319 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  59.23 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  59.23 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  62.27 
 
 
319 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  59.93 
 
 
319 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  61.54 
 
 
319 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  57.69 
 
 
330 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  60.63 
 
 
325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  60.35 
 
 
328 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  59.93 
 
 
314 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  58.89 
 
 
312 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  59.38 
 
 
311 aa  348  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  58.36 
 
 
317 aa  342  5.999999999999999e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  51.61 
 
 
321 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  51.61 
 
 
331 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.36 
 
 
282 aa  292  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  51.25 
 
 
330 aa  291  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  51.61 
 
 
333 aa  291  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  53.14 
 
 
296 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  51.08 
 
 
330 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  50.72 
 
 
334 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  50.54 
 
 
357 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  51.25 
 
 
333 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  51.25 
 
 
333 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  50.71 
 
 
339 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  48.76 
 
 
321 aa  287  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  50.71 
 
 
318 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  50.36 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  49.82 
 
 
294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  51.27 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  51.25 
 
 
321 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  52.14 
 
 
297 aa  285  4e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  50.72 
 
 
334 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  50.36 
 
 
329 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  50.36 
 
 
329 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  50.36 
 
 
329 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  50.36 
 
 
329 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  50.72 
 
 
335 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  50.36 
 
 
329 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  50.36 
 
 
329 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  50.36 
 
 
329 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  48.58 
 
 
294 aa  285  8e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  53.54 
 
 
335 aa  285  9e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  50.36 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  50.36 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  50.36 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  50.71 
 
 
318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  55.82 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  52.4 
 
 
315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  50.18 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  52.4 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  51.47 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>