More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0542 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  100 
 
 		 297 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  79.73 
 
 		 291 aa  498  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  79.79 
 
 		 306 aa  487  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  78.55 
 
 		 294 aa  484  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  78.2 
 
 		 289 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  77.85 
 
 		 289 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  76.63 
 
 		 292 aa  477  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  75.78 
 
 		 289 aa  470  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  71.97 
 
 		 294 aa  437  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  68.17 
 
 		 297 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  69.2 
 
 		 289 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19551  lipoyl synthase  69.2 
 
 		 289 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2014  lipoyl synthase  69.9 
 
 		 296 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.812557  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  69.2 
 
 		 294 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17061  lipoyl synthase  67.24 
 
 		 297 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0328  lipoyl synthase  70.59 
 
 		 289 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0868642 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17181  lipoyl synthase  65.86 
 
 		 297 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.49341  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1606  lipoyl synthase  66.9 
 
 		 297 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  56.16 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  54.48 
 
 		 299 aa  322  4e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  55.2 
 
 		 287 aa  322  6e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  54.2 
 
 		 297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  56.23 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  53.76 
 
 		 337 aa  319  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  55.43 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  55.64 
 
 		 315 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  56.88 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  55.43 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  54.74 
 
 		 325 aa  315  8e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  53.99 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  56.16 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  53.96 
 
 		 318 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  53.96 
 
 		 339 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  55.07 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 320 aa  310  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  54.71 
 
 		 322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  53.17 
 
 		 310 aa  309  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  54.35 
 
 		 319 aa  308  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  55.07 
 
 		 325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  53.07 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  53.99 
 
 		 319 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  55.07 
 
 		 316 aa  308  8e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  55.07 
 
 		 320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  51.99 
 
 		 325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  55.07 
 
 		 320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  55.11 
 
 		 317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  54.87 
 
 		 315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  54.35 
 
 		 298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  53.43 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  54.35 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  51.43 
 
 		 355 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  51.43 
 
 		 321 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  54.68 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  54.01 
 
 		 321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50 
 
 		 291 aa  305  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 321 aa  305  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  52.71 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  52.71 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  52.5 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  53.65 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  54.01 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  53.99 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  53.28 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  51.94 
 
 		 340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  53.28 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  53.28 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  53.26 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  53.65 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  53.07 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  53.99 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  53.02 
 
 		 322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  54.15 
 
 		 322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 357 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  54.35 
 
 		 339 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  51.99 
 
 		 330 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  53.82 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  51.99 
 
 		 330 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  52.16 
 
 		 331 aa  302  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  51.99 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  54.35 
 
 		 339 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 321 aa  301  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 321 aa  301  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 321 aa  301  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  53.12 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.6 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  51.43 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>