More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_17181 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_17181  lipoyl synthase  100 
 
 
297 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.49341  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1606  lipoyl synthase  94.61 
 
 
297 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217435  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17061  lipoyl synthase  92.59 
 
 
297 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  84.18 
 
 
297 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  75.26 
 
 
294 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  75.96 
 
 
289 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2014  lipoyl synthase  72.79 
 
 
296 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.812557  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19551  lipoyl synthase  75.96 
 
 
289 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0328  lipoyl synthase  72.47 
 
 
289 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0868642 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  70.03 
 
 
294 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  66.9 
 
 
289 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  66.55 
 
 
289 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  65.52 
 
 
291 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  65.86 
 
 
297 aa  417  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  65.86 
 
 
306 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  66.9 
 
 
294 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  65.51 
 
 
289 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  63.45 
 
 
292 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  51.75 
 
 
309 aa  315  5e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  52.16 
 
 
287 aa  306  3e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  50.88 
 
 
297 aa  300  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  50.89 
 
 
306 aa  299  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  52.13 
 
 
318 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  50 
 
 
340 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  50.18 
 
 
331 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  51.42 
 
 
322 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  49.47 
 
 
339 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  49.47 
 
 
318 aa  295  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  50.18 
 
 
298 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  50.52 
 
 
335 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  50 
 
 
315 aa  294  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  51.06 
 
 
328 aa  294  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  51.22 
 
 
325 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  50.52 
 
 
318 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  51.06 
 
 
322 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  49.65 
 
 
323 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  49.65 
 
 
327 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  49.29 
 
 
357 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  49.47 
 
 
351 aa  291  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  291  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  48.26 
 
 
321 aa  291  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  48.76 
 
 
299 aa  291  9e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  49.64 
 
 
321 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  50.9 
 
 
325 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  51.25 
 
 
324 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  50 
 
 
330 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  49.3 
 
 
338 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  49.3 
 
 
338 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  49.3 
 
 
338 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  49.3 
 
 
332 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  49.3 
 
 
338 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  49.64 
 
 
321 aa  289  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  49.64 
 
 
330 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  48.59 
 
 
327 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  48.94 
 
 
321 aa  289  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  48.94 
 
 
321 aa  289  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  49.64 
 
 
330 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  50 
 
 
334 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  50.36 
 
 
323 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  48.94 
 
 
321 aa  289  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  48.08 
 
 
355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  51.61 
 
 
280 aa  288  6e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  47.5 
 
 
325 aa  288  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  49.46 
 
 
320 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  49.46 
 
 
320 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  49.64 
 
 
329 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  49.12 
 
 
326 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  48.21 
 
 
321 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  48.93 
 
 
330 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  49.64 
 
 
334 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  50 
 
 
335 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  48.93 
 
 
330 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  48.93 
 
 
330 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  48.23 
 
 
321 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  49.29 
 
 
329 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  49.29 
 
 
329 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  48.25 
 
 
326 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  48.25 
 
 
326 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  49.29 
 
 
329 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  49.29 
 
 
329 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  49.29 
 
 
329 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  47.89 
 
 
332 aa  285  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  49.29 
 
 
329 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  49.29 
 
 
329 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  49.64 
 
 
323 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  47.87 
 
 
321 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  46.67 
 
 
310 aa  285  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  47.48 
 
 
325 aa  285  8e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  48.94 
 
 
330 aa  285  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  47.75 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  47.7 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  47.7 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0867  lipoyl synthase  47.87 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.719819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  47.16 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  47.7 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  49.29 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  47.55 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  47.7 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  49.64 
 
 
323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  47.35 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>