More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2014 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2014  lipoyl synthase  100 
 
 		 296 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.812557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0328  lipoyl synthase  89.62 
 
 		 289 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0868642 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  82.43 
 
 		 294 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  81.72 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  78.55 
 
 		 289 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19551  lipoyl synthase  78.55 
 
 		 289 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  72.26 
 
 		 297 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17181  lipoyl synthase  72.79 
 
 		 297 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.49341  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17061  lipoyl synthase  71.77 
 
 		 297 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1606  lipoyl synthase  72.11 
 
 		 297 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  69.9 
 
 		 306 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  69.79 
 
 		 294 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  69.9 
 
 		 297 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  68.17 
 
 		 289 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  67.71 
 
 		 291 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  68.06 
 
 		 289 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  65.05 
 
 		 289 aa  400  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  64.36 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  53.66 
 
 		 287 aa  310  2e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  52.82 
 
 		 325 aa  308  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  54.58 
 
 		 321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  51.94 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  53.19 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  53.85 
 
 		 315 aa  301  7.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  51.93 
 
 		 340 aa  298  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  53.24 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  52.88 
 
 		 318 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  52.33 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  52.33 
 
 		 318 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  52.8 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  52.82 
 
 		 351 aa  295  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  52.28 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  51.77 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  52.28 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  52.28 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  52.28 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  52.28 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  51.76 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  52.28 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  52.28 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  52.13 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  51.93 
 
 		 329 aa  291  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  48.77 
 
 		 355 aa  291  8e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  51.59 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  51.42 
 
 		 322 aa  291  9e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  54.15 
 
 		 325 aa  290  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 326 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  51.42 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  50.52 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  50.52 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 320 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  52.19 
 
 		 311 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 338 aa  288  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 327 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  52.46 
 
 		 330 aa  288  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 330 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 338 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 330 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  51.24 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  52.05 
 
 		 323 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 338 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  51.61 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 319 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  51.61 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  51.58 
 
 		 325 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  52.54 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 323 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  52.54 
 
 		 324 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  51.03 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 325 aa  285  5e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  52.16 
 
 		 337 aa  285  5.999999999999999e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 320 aa  285  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 311 aa  285  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 333 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  48.78 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 333 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  50.34 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  51.99 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>