More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0610 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  100 
 
 
283 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  64.1 
 
 
282 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  58.87 
 
 
291 aa  352  5e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  58.39 
 
 
321 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  58.21 
 
 
296 aa  326  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  55.43 
 
 
320 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  55.23 
 
 
328 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  53.99 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  53.26 
 
 
321 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  55.27 
 
 
299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  54.71 
 
 
323 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  55.6 
 
 
297 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  55.8 
 
 
323 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  54.71 
 
 
323 aa  318  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  55.8 
 
 
323 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  55.23 
 
 
316 aa  316  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3150  lipoyl synthase  55.64 
 
 
283 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  55.6 
 
 
320 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  53.9 
 
 
320 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  53.74 
 
 
292 aa  316  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  52.67 
 
 
291 aa  315  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  53.6 
 
 
312 aa  315  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  52.86 
 
 
319 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  51.81 
 
 
322 aa  315  7e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  51.81 
 
 
322 aa  314  8e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  53.82 
 
 
287 aa  313  9.999999999999999e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  53.43 
 
 
334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  53.68 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  53.68 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  53.43 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  54.32 
 
 
315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  53.38 
 
 
289 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  52.46 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  55.91 
 
 
308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  53.68 
 
 
330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  53.43 
 
 
339 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  53.38 
 
 
289 aa  311  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  51.82 
 
 
329 aa  312  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  55.93 
 
 
280 aa  312  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  53.33 
 
 
330 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  52.11 
 
 
332 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  53.21 
 
 
320 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  53.21 
 
 
320 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  53.33 
 
 
329 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  52.88 
 
 
310 aa  311  6.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  53.33 
 
 
329 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  53.33 
 
 
329 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  51.97 
 
 
319 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  53.33 
 
 
329 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  52.63 
 
 
331 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  51.96 
 
 
306 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  53.82 
 
 
300 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  52.98 
 
 
334 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  53.28 
 
 
321 aa  309  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  52.98 
 
 
330 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  52.11 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  52.69 
 
 
327 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  52.98 
 
 
334 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  52.86 
 
 
319 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  52.98 
 
 
330 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  52.98 
 
 
330 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  51.99 
 
 
317 aa  309  4e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  52.11 
 
 
333 aa  308  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  51.76 
 
 
333 aa  308  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  52.54 
 
 
317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  52.98 
 
 
329 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  52.98 
 
 
329 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  52.73 
 
 
319 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  52.98 
 
 
329 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  52.98 
 
 
329 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  51.41 
 
 
326 aa  308  8e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  51.41 
 
 
326 aa  308  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  53.79 
 
 
330 aa  308  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  54.32 
 
 
318 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  53.62 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  53.62 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  53.26 
 
 
291 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  52.5 
 
 
355 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  50.7 
 
 
357 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  51.93 
 
 
330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  51.99 
 
 
311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  51.6 
 
 
289 aa  306  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  52.63 
 
 
335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  51.41 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  52.67 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  53.74 
 
 
288 aa  306  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  51.41 
 
 
331 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  53.02 
 
 
326 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  51.79 
 
 
319 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  53.09 
 
 
319 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  53.02 
 
 
326 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  53.02 
 
 
326 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  55.84 
 
 
309 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  51.25 
 
 
294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  51.23 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  52.9 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  53.45 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  52 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  50.7 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  52.71 
 
 
336 aa  302  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>