More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2200 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  100 
 
 		 317 aa  648    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  100 
 
 		 317 aa  648    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  66.13 
 
 		 320 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  67.8 
 
 		 311 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  63.4 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  64.12 
 
 		 324 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  62.05 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1987  lipoyl synthase  64.92 
 
 		 316 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  65.89 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  63.12 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  63.12 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  62.71 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  63.12 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  63.46 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  62.71 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  63.12 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  63.64 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  64.03 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  62.71 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  63.12 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  63.46 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  63.12 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  62.71 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  63.12 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  62.54 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  63.12 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  60.58 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  59.35 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  60.58 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  60.58 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  61.31 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  63.12 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  60.58 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  60.06 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  60.58 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  59.03 
 
 		 320 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  59.94 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  60.58 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  61.59 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  60.26 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  60.58 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  61.29 
 
 		 315 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  63.12 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  60.06 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  63.12 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  63.12 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  59.74 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  61.92 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  61.31 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  63.12 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  63.34 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  62.75 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  61.13 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  59.94 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  62.21 
 
 		 321 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  60.26 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  58.06 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  61.24 
 
 		 325 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  59.94 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  60.8 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  62.75 
 
 		 335 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  61.54 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  61.87 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  60.53 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  62.79 
 
 		 321 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  58.28 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  60.8 
 
 		 334 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  60.8 
 
 		 335 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  59.29 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  59.29 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  59.29 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  61.2 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  60.54 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  61.82 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  58.28 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1961  lipoyl synthase  58.31 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  62.16 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  61.54 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  61.54 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  60.54 
 
 		 321 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  59.8 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  58.99 
 
 		 318 aa  374  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  62.16 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  61.54 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  61.54 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  61.54 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  61.54 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  61.54 
 
 		 321 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  57.52 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0287  lipoyl synthase  59.67 
 
 		 314 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0533885  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  59.42 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  60.87 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  61.2 
 
 		 321 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0867  lipoyl synthase  61.54 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.719819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  60.87 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  59.35 
 
 		 324 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  60.87 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  59.73 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  61.2 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  60.54 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>