More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0899 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  56.06 
 
 
296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  54.68 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  52.14 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  51.8 
 
 
326 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  51.8 
 
 
326 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  51.44 
 
 
294 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  51.44 
 
 
326 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  51.93 
 
 
328 aa  294  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  49.82 
 
 
350 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  55.89 
 
 
291 aa  293  2e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  47.8 
 
 
401 aa  290  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  51.61 
 
 
329 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  51.25 
 
 
329 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.61 
 
 
321 aa  285  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  52.27 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  50.94 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  51.12 
 
 
348 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  49.09 
 
 
368 aa  278  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  51.47 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  49.25 
 
 
282 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  46.85 
 
 
413 aa  271  8.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  50.94 
 
 
276 aa  271  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  49.26 
 
 
308 aa  270  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  49.09 
 
 
311 aa  270  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  44.83 
 
 
398 aa  269  4e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  49.45 
 
 
298 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  50.18 
 
 
298 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  48.55 
 
 
355 aa  267  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  47.67 
 
 
314 aa  267  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  49.43 
 
 
321 aa  265  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  48.35 
 
 
305 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  47.46 
 
 
296 aa  264  1e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  48.35 
 
 
305 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  49.11 
 
 
298 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  49.11 
 
 
298 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  47.69 
 
 
303 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  49.11 
 
 
298 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  47.69 
 
 
303 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  46.95 
 
 
320 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  47.69 
 
 
337 aa  262  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  49.11 
 
 
298 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  49.29 
 
 
298 aa  262  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  49.81 
 
 
280 aa  262  6e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  49.29 
 
 
298 aa  261  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  49.81 
 
 
395 aa  261  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  48.93 
 
 
298 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  46.3 
 
 
282 aa  260  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  48.93 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  48.93 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  48.93 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  48.93 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  47.25 
 
 
304 aa  259  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  46.57 
 
 
320 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  50.19 
 
 
321 aa  258  7e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  50.39 
 
 
314 aa  258  8e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  49.08 
 
 
315 aa  258  9e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  49.08 
 
 
315 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  49.62 
 
 
311 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  47.55 
 
 
321 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  47.46 
 
 
322 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  49.08 
 
 
399 aa  256  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  49.23 
 
 
318 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  47.17 
 
 
321 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  48.34 
 
 
291 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  45.71 
 
 
323 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  45.8 
 
 
312 aa  256  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  50.56 
 
 
300 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  46.49 
 
 
325 aa  255  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  50.38 
 
 
304 aa  255  6e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  44.56 
 
 
321 aa  254  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  48.34 
 
 
312 aa  254  8e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  47.35 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  50.19 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  49.81 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  47.76 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  45.26 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  46.82 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  44.6 
 
 
338 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  44.6 
 
 
338 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  44.6 
 
 
338 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  46.67 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  44.6 
 
 
338 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  47.31 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  48.31 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  47.01 
 
 
329 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  46.77 
 
 
339 aa  252  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  47.01 
 
 
329 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  47.01 
 
 
329 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  46.77 
 
 
304 aa  252  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  47.01 
 
 
329 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  45.13 
 
 
320 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  47.01 
 
 
329 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  45.13 
 
 
320 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  46.97 
 
 
321 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  45.42 
 
 
335 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  46.24 
 
 
318 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  47.01 
 
 
329 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  47.01 
 
 
329 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  47.01 
 
 
329 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>