More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3051 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  100 
 
 
298 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  95.3 
 
 
298 aa  597  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  85.17 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  85.17 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  85.17 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  85.17 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  85.17 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  85.52 
 
 
298 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  85.17 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  85.17 
 
 
298 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  84.48 
 
 
298 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  84.83 
 
 
298 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  84.14 
 
 
298 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  79.73 
 
 
304 aa  504  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  80.41 
 
 
305 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  80.41 
 
 
305 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  67.27 
 
 
308 aa  394  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  58.8 
 
 
321 aa  343  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  58.51 
 
 
328 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  58.06 
 
 
303 aa  330  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  52.45 
 
 
304 aa  331  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  58.06 
 
 
303 aa  330  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  54.48 
 
 
292 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  54.79 
 
 
298 aa  323  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  54.64 
 
 
298 aa  319  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  53.82 
 
 
321 aa  318  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  54.32 
 
 
299 aa  318  7.999999999999999e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  53.96 
 
 
290 aa  318  9e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  53.96 
 
 
288 aa  315  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  55.83 
 
 
328 aa  315  7e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  54.09 
 
 
329 aa  310  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  52.16 
 
 
291 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  54.45 
 
 
329 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  52.86 
 
 
302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  52.33 
 
 
290 aa  308  8e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  53.68 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  53.63 
 
 
312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  52.78 
 
 
351 aa  307  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  53.68 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  54.84 
 
 
304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  53.68 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  53.24 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  57.63 
 
 
276 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  53.33 
 
 
321 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  51.9 
 
 
317 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  50.34 
 
 
322 aa  305  6e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  50.34 
 
 
322 aa  305  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  53.33 
 
 
321 aa  305  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  53.15 
 
 
325 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  53.33 
 
 
321 aa  305  7e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  52.94 
 
 
339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  52.98 
 
 
321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  52.94 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  50.69 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  51.93 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  54.32 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  52.58 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  52.6 
 
 
334 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  51.6 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  51.39 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  51.03 
 
 
315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  52.63 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  53.45 
 
 
321 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  50.17 
 
 
322 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  54.12 
 
 
331 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  53.33 
 
 
321 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  53.33 
 
 
321 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  52.94 
 
 
319 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  53.33 
 
 
321 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  52.08 
 
 
320 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  52.08 
 
 
320 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  51.92 
 
 
321 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  53.33 
 
 
321 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  53.33 
 
 
321 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  53.33 
 
 
321 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  53.33 
 
 
321 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  53.33 
 
 
321 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  53.33 
 
 
321 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  51.39 
 
 
325 aa  299  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  50.88 
 
 
299 aa  299  3e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  51.23 
 
 
319 aa  300  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  51.56 
 
 
327 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  51.44 
 
 
321 aa  299  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  52.71 
 
 
329 aa  299  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  51.22 
 
 
373 aa  299  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  51.22 
 
 
373 aa  299  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  51.23 
 
 
319 aa  299  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  50.35 
 
 
282 aa  298  7e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  52.61 
 
 
320 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  52.08 
 
 
287 aa  298  8e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  48.48 
 
 
357 aa  298  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  54.18 
 
 
283 aa  298  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  51.22 
 
 
321 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  51.69 
 
 
321 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  50.86 
 
 
314 aa  297  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  51.22 
 
 
321 aa  297  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  53.57 
 
 
315 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  53.57 
 
 
315 aa  297  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  50.69 
 
 
330 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  51.22 
 
 
320 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>